RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dsg3O35902 993 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tsta3P23591 321 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 NrlP54846 237 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Upf3aQ3ULJ3 422 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ifnl2Q4VK74 193 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Itga3Q62470 1053 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cpa4Q6P8K8 420 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rasa4Q6PFQ7 802 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q80Y73 168 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc9a7Q8BLV3 726 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zmym6Q8BS54 1249 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppfia2Q8BSS9 1257 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gramd4Q8CB44 633 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Spred2Q924S7 410 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Htra2Q9JIY5 458 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pex11bQ9Z210 259 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Scn5aQ9JJV9 2019 aa20.33■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Vmn2r39L7N2E5 861 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atxn1lP0C7T6 687 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Msx3P70354 204 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Irx1P81068 480 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf800Q0VEE6 662 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Aldh1a2Q62148 518 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 VwdeQ6DFV8 926 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam109aQ8BH49 266 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hectd2Q8CDU6 774 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Serpina1fQ9DCQ7 411 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 NbnQ9R207 751 aa20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sf3b1Q99NB9 1304 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 BC025446A0A087WQT1 134 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm8113E0CXS8 587 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccl26F8VQM2 93 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cyp4f40G3UW81 524 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Itm2bO89051 266 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gja8P28236 440 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp46P62069 366 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 InscQ3HNM7 579 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cldn11Q60771 207 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 PrkciQ62074 595 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr1057Q7TR75 315 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q810S2 196 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 E330017A01RikQ8BU47 192 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mkl1Q8K4J6 964 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 SarafQ8R3Q0 334 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 PpanQ91YU8 470 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q922M7 232 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gemin2Q9CQQ4 269 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Noxred1Q9D3S5 366 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kifc1Q9QWT9 674 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Odc1P00860 461 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lsp1P19973 330 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 AcrP23578 436 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc11a2P49282 568 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 YwhagP61982 247 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 SkiQ60698 725 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ksr1Q61097 873 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 RadilQ69Z89 1099 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gpr142Q7TQN9 365 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wnk4Q80UE6 1222 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wdr59Q8C0M0 992 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc65Q8VHI7 493 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Clp1Q99LI9 425 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam173bQ9D1Z3 247 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 DmgdhQ9DBT9 869 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 SgshQ9EQ08 502 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dgcr8Q9EQM6 773 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Acox2Q9QXD1 681 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Snx1Q9WV80 522 aa20.31■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Siah3B2RWG3 268 aa20.3■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf746Q3U133 652 aa20.3■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Serac1Q3U213 654 aa20.3■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdkn3Q810P3 211 aa20.3■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Efcab14Q8BGQ6 484 aa20.3■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cnot10Q8BH15 744 aa20.3■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pcdhb19Q91Y01 801 aa20.3■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa20.3■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Chmp2aQ9DB34 222 aa20.3■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rmdn1Q9DCV4 305 aa20.3■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfy2P20662 777 aa20.29■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Flt3lgP49772 232 aa20.29■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arpp19P56212 112 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arl4aP61213 200 aa20.29■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdh9P70407 786 aa20.29■□□□□ 0.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm14685Q52KH6 695 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59.5 ms