RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029421.5

Ptx3-201, Transcript of Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx3, Length 1,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3-201ENSMUST00000029421 PostnQ62009 838 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Tpp2Q64514 1262 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ssxb5Q6XAS2 159 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Cpa1Q7TPZ8 419 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Fbxw21Q8BI38 468 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ttc39bQ8BYY4 617 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Kctd12bQ8C7J6 292 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Amer2Q8CCJ4 672 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Rnf208Q8K0W3 265 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ace2Q8R0I0 805 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Cd300ldQ8VCH2 221 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Spns2Q91VM4 549 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Akirin1Q99LF1 191 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 HgsQ99LI8 775 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Acbd6Q9D061 282 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Slc25a19Q9DAM5 318 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Plscr2Q9DCW2 307 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 PigrO70570 771 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Cyp2c37P56654 490 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Zbtb14Q08376 449 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Uimc1Q5U5Q9 727 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Fam102aQ78T81 392 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Tmem220Q8BP07 167 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Apol7cQ8C6E1 369 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Cyp2c50Q91X77 490 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 CoprsQ9CQ13 173 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 GarsQ9CZD3 729 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Mxra7Q9CZH7 178 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Tspan17Q9D7W4 270 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Actl7bQ9QY83 418 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ror2Q9Z138 944 aa22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ssxb9A2BI93 185 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Olfr1354E9Q5G9 310 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Mroh4G3X8W1 983 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 2610008E11RikG3X964 669 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gsta3P30115 221 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ccng1P51945 294 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 NcstnP57716 708 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Pfkfb2P70265 519 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Cd163Q2VLH6 1121 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 OtulinQ3UCV8 352 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Scube3Q66PY1 993 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Il36gQ8R460 164 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Clstn3Q99JH7 956 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Them5Q9CQJ0 248 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Oxct1Q9D0K2 520 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Trpv2Q9WTR1 756 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Map2k5Q9WVS7 448 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gm3424L7N298 263 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gm8246M0QWX9 263 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 UmpsP13439 481 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Kif5aP33175 1027 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Sem1P60897 70 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Zbtb48Q1H9T6 681 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Mea1Q64327 174 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Olfr1105Q7TR58 312 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Dnajc16Q80TN4 772 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Znf76Q8BMU0 568 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Slc39a13Q8BZH0 361 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ccdc159Q8C963 411 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Timd2Q8R183 305 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gps1Q99LD4 471 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Slc13a1Q9JHI4 594 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Capn15Q9JLG8 1095 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Piwil1Q9JMB7 862 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 MycsQ9Z304 431 aa22.94■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Cyp4f40G3UW81 524 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 P01644 108 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 P01645 108 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 P01646 108 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 P01647 108 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Cfhr2Q4LDF6 332 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Trim38Q5SZ99 471 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Prl3a1Q78Y73 227 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Trem2Q99NH8 227 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Copg2Q9QXK3 871 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Plxna1P70206 1894 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ccnb1P24860 430 aa22.92■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 GlrbP48168 496 aa22.92■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Npas2P97460 816 aa22.92■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 PrkciQ62074 595 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Rbl2Q64700 1135 aa22.92■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Fcrl5Q68SN8 596 aa22.92■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 ShbQ6PD21 503 aa22.92■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Lig4Q8BTF7 911 aa22.92■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Anapc5Q8BTZ4 740 aa22.92■■□□□ 1.26
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.1 ms