RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	TTC3	P53804	2025 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	TTC34	A8MYJ7	566 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227		F8W810	466 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	WDR47	O94967	919 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	MT-ND5	P03915	603 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	RPS6KB1	P23443	525 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	DUSP1	P28562	367 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ERV3-1	Q14264	604 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ACOX1	Q15067	660 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	MANEA	Q5SRI9	462 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	UNC13D	Q70J99	1090 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM57B	Q71RH2	274 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	P3H2	Q8IVL5	708 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	UEVLD	Q8IX04	471 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	FCRL5	Q96RD9	977 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	VPS45	Q9NRW7	570 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	HPSE	Q9Y251	543 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	LRP12	Q9Y561	859 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	PRAMEF2	O60811	474 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	TFEB	P19484	476 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	MATN1	P21941	496 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	PEX2	P28328	305 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	NTSR1	P30989	418 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	GALNS	P34059	522 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	HTR7	P34969	479 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	MTAP	Q13126	283 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	KCNJ12	Q14500	433 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	GBX1	Q14549	363 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	RNF44	Q7L0R7	432 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	SESTD1	Q86VW0	696 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	PIGK	Q92643	395 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	SNX22	Q96L94	193 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	NLRP4	Q96MN2	994 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	TM2D2	Q9BX73	214 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	DECR2	Q9NUI1	292 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNAP23-215	ENST00000568227	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		2.91	□□□□□ -1.94

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