RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567329.1

USP7-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 7, human

TSL 4

Gene USP7, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP7-217	ENST00000567329	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329		A0A0J9YVX5	310 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	FAM221A	A4D161	298 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	YDJC	A8MPS7	323 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329		E9PBE3	544 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329		H0YJX3	145 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329		H3BRJ5	948 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ZBTB5	O15062	677 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	VILL	O15195	856 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	FAM189A1	O60320	539 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SPAG6	O75602	509 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	PROSC	O94903	275 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	KLHL2	O95198	593 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	GCNT3	O95395	438 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	MYL4	P12829	197 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	PLS3	P13797	630 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SELP	P16109	830 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	AOC1	P19801	751 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	RRM1	P23921	792 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	PRDX6	P30041	224 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	GTF2H1	P32780	548 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SOX9	P48436	509 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	NEK3	P51956	506 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ARL4C	P56559	192 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	GPSM2	P81274	684 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	FMO1	Q01740	532 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ZNF543	Q08ER8	600 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	LRRC38	Q5VT99	294 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ATG16L1	Q676U5	607 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	RASSF3	Q86WH2	238 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	PALB2	Q86YC2	1186 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SULF2	Q8IWU5	870 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	BBS5	Q8N3I7	341 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	NUDT8	Q8WV74	236 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	MPP4	Q96JB8	637 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	C9orf72	Q96LT7	481 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	BIRC8	Q96P09	236 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	PANX3	Q96QZ0	392 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	FIZ1	Q96SL8	496 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	TMEM206	Q9H813	350 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	PARVG	Q9HBI0	331 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	UBP1	Q9NZI7	540 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	TBK1	Q9UHD2	729 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	RAB26	Q9ULW5	256 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	DMTF1	Q9Y222	760 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		7.23	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		7.23	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		7.23	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	CLIC2	O15247	247 aa		7.23	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	7.23	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SGPL1	O95470	568 aa		7.23	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	ITGAV	P06756	1048 aa		7.23	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SERPINA6	P08185	405 aa		7.23	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	CD48	P09326	243 aa		7.23	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
USP7-217	ENST00000567329	SLURP2	P0DP57	97 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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