RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-208ENST00000551676 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 HSFX1Q9UBD0 423 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 INSL6Q9Y581 213 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 DAPK3O43293 454 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 ATP8B1O43520 1251 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 SOAT2O75908 522 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 ABLIM3O94929 683 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 APOC2P02655 101 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 RPL17P18621 184 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 ADRA1BP35368 520 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 DYNLT1P63172 113 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 OASLQ15646 514 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 BTBD8Q5XKL5 378 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 TPGS2Q68CL5 300 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 TAC4Q86UU9 113 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PQLC3Q8N755 202 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PCDH19Q8TAB3 1148 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM118BQ9BPY3 351 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM204AQ9H8W3 233 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 DNPEPQ9ULA0 475 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 NFU1Q9UMS0 254 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 A0A1W2PQH9 124 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 C2CD2LO14523 706 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 ECHS1P30084 290 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 VCPP55072 806 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 LMNB2Q03252 620 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 SLC9A4Q6AI14 798 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 EMBQ6PCB8 327 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 ACTL9Q8TC94 416 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 MAGEB5Q9BZ81 275 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 GAS8O95995 478 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 YWHAQP27348 245 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 TUFMP49411 452 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PTK6Q13882 451 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 ZNF461Q8TAF7 563 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 SMOC2Q9H3U7 446 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 TMEM51Q9NW97 253 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.871e-6■□□□□ 11.2
PPP1CC-208ENST00000551676 COX16Q9P0S2 106 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PLXNA3P51805 1871 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 URODP06132 367 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 ITGAVP06756 1048 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 KRT17Q04695 432 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 RAB33AQ14088 237 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 EFHC2Q5JST6 749 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 HERC6Q8IVU3 1022 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 VPS52Q8N1B4 723 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PLD5Q8N7P1 536 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 STKLD1Q8NE28 680 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 CAVIN3Q969G5 261 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 HAUS1Q96CS2 278 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 RAD9AQ99638 391 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 ZBED2Q9BTP6 218 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 FUT8Q9BYC5 575 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 OSER1Q9NX31 292 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 APOL1O14791 398 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 LILRB3O75022 631 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 TGM2P21980 687 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 GBP1P32455 592 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 NNTQ13423 1086 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PPP1R7Q15435 360 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 MSANTD2Q6P1R3 559 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PYROXD2Q8N2H3 581 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 GPR152Q8TDT2 470 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 CSPG4P5Q96PW8 444 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 TTLL2Q9BWV7 592 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 TRIM31Q9BZY9 425 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 DPH5Q9H2P9 285 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 GMIPQ9P107 970 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 FGF18O76093 207 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 ATF6P18850 670 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 ALLCQ8N6M5 410 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 CCDC114Q96M63 670 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 WDCPQ9H6R7 721 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 ANLNQ9NQW6 1124 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 CLIC5Q9NZA1 410 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CC-208ENST00000551676 GRHL1Q9NZI5 618 aa26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms