RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544547.5

LIMS1-215, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 4,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-215ENST00000544547 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 AP3B1O00203 1094 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 INPP5AQ14642 412 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 PNPOQ9NVS9 261 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 KCND2Q9NZV8 630 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 KRT72Q14CN4 511 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 RNF139Q8WU17 664 aa14.65□□□□□ -0.06
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LIMS1-215ENST00000544547 PANX3Q96QZ0 392 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 EURLQ9NYK6 297 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 SERPINE1P05121 402 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 ADRA2BP18089 450 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 KRT76Q01546 638 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 SFT2D3Q587I9 215 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 UBA3Q8TBC4 463 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 SEC14L1Q92503 715 aa14.65□□□□□ -0.06
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LIMS1-215ENST00000544547 EBF4Q9BQW3 602 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 ACSS2Q9NR19 701 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 SPEF2Q9C093 1822 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 H3BSA7 217 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 GJA8P48165 433 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 BFSP2Q13515 415 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 NR1D2Q14995 579 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 DLGAP3O95886 979 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 COX4I1P13073 169 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 DDIASQ8IXT1 998 aa14.64□□□□□ -0.07
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LIMS1-215ENST00000544547 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 CFAP99D6REC4 459 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 SMAPO00193 183 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 MAGEB3O15480 346 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 SLC26A4O43511 780 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 CDH3P22223 829 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 AVPR1AP37288 418 aa14.64□□□□□ -0.07
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LIMS1-215ENST00000544547 DPYSL3Q14195 570 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 MYBPC3Q14896 1274 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.64□□□□□ -0.07
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LIMS1-215ENST00000544547 SHC3Q92529 594 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 MMP19Q99542 508 aa14.64□□□□□ -0.07
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LIMS1-215ENST00000544547 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 CBFA2T3O75081 653 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 ADRB2P07550 413 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 TM4SF1P30408 202 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 HPCAP84074 193 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 CEP19Q96LK0 163 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 CEP41Q9BYV8 373 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 CLOCKO15516 846 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 ZNF23P17027 643 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-215ENST00000544547 GRK2P25098 689 aa14.64□□□□□ -0.07
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