RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNDQ07001 517 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CBFBQ13951 182 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 GALNTL6Q49A17 601 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 Q96MF0 132 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 KCND3Q9UK17 655 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SPRY2O43597 315 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 C1SP09871 688 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF20P17024 532 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SEC24CP53992 1094 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK7Q13164 816 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 FZD5Q13467 585 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CTXN3Q4LDR2 81 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 WDR78Q5VTH9 848 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 BBS12Q6ZW61 710 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SYT13Q7L8C5 426 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 OR4N4Q8N0Y3 316 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PROKR1Q8TCW9 393 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 RFKQ969G6 155 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TWNKQ96RR1 684 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SNX15Q9NRS6 342 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 DKK3Q9UBP4 350 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CES2O00748 559 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN3O60637 253 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TJP3O95049 919 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ELF1P32519 619 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 THBS4P35443 961 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TUBA3CQ13748 450 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 DLGAP5Q15398 846 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CYP1B1Q16678 543 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TXNRD1Q16881 649 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 AAK1Q2M2I8 961 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 USP51Q70EK9 711 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 LCORLQ8N3X6 602 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PRR25Q96S07 402 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 MECRQ9BV79 373 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 AMFRQ9UKV5 643 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 VWC2LB2RUY7 222 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 NR2F6P10588 404 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 KRT9P35527 623 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 E2F1Q01094 437 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 DNASE1L3Q13609 305 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PTPAQ15257 358 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CDSNQ15517 529 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 KAZNQ674X7 775 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZWC4 215 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 FSIP1Q8NA03 581 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM160Q9NX00 188 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC151A5D8V7 595 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 A6NLC8 198 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TISP43B9A030 160 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 AP4M1O00189 453 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 NKX2-8O15522 239 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TNFAIP3P21580 790 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MCM5P33992 734 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 CASP2P42575 452 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZNX1 250 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MRGPREQ86SM8 312 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 HTRA1Q92743 480 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.64□□□□□ -1.03
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