RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 KIF18AQ8NI77 898 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 SMYD3Q9H7B4 428 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 STARD13Q9Y3M8 1113 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 RAD54BQ9Y620 910 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP8B3O60423 1300 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 KALRNO60229 2985 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 CLIC2O15247 247 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFS2O75306 463 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 YEATS4O95619 227 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 CAPNS1P04632 268 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM163BP0C2L3 166 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 FTH1P19P0C7X4 201 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 PGFP49763 221 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 TUBP50607 506 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 CDH8P55286 799 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 CCZ1BP86790 482 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP24A1Q07973 514 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 PSMD6Q15008 389 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 SNX30Q5VWJ9 437 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 BBS2Q9BXC9 721 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM9Q9C026 710 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 CD248Q9HCU0 757 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 PRRT4C9JH25 899 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 TGFB1I1O43294 461 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 TLR5O60602 858 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 GJB3O75712 270 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 AP1G2O75843 785 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 SLU7O95391 586 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 TYRP14679 529 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 MAOBP27338 520 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 CAMK4Q16566 473 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 TPGS1Q6ZTW0 290 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 PAQR9Q6ZVX9 377 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 NAXDQ8IW45 347 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 SCFD1Q8WVM8 642 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF516Q92618 1163 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 ELMO3Q96BJ8 720 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 SMARCD1Q96GM5 515 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 GABRG3Q99928 467 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 XYLT2Q9H1B5 865 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 KRT82Q9NSB4 513 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 IL37Q9NZH6 218 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 GPSM3Q9Y4H4 160 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC66A2RUB6 948 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 BECN2A8MW95 431 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 IKBKBO14920 756 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 CACNG3O60359 315 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 PHACTR2O75167 634 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 TBX18O95935 607 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 GNSP15586 552 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 LRMPQ12912 555 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 GRIK2Q13002 908 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC14A1Q13336 389 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 SYCP2LQ5T4T6 812 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 NELFCDQ8IXH7 590 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 XXYLT1Q8NBI6 393 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF507Q8TCN5 953 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 TSC1Q92574 1164 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 BHMTQ93088 406 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 MRGPRX1Q96LB2 322 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 TIGD1Q96MW7 591 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 SUSD2Q9UGT4 822 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM92AA1XBS5 289 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 MEI4A8MW99 385 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 WASH3PC4AMC7 463 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 GREM1O60565 184 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 BEST1O76090 585 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 STAU1O95793 577 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 TPM1P09493 284 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 SKILP12757 684 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC130P13994 396 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 ATICP31939 592 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 CASP4P49662 377 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 TPM4P67936 248 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 ASIC1P78348 528 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 ORC1Q13415 861 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 BIRC3Q13489 604 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF699Q32M78 642 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 WDR45BQ5MNZ6 344 aa12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 157.8 ms