RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 ADAM23O75077 832 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 SLC9A1P19634 815 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 MFAP3P55082 362 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 SEC13P55735 322 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 KDSRQ06136 332 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 EXOC3L4Q17RC7 722 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 EOGTQ5NDL2 527 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 EMC10Q5UCC4 262 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 FYB2Q5VWT5 728 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 GRAMD4Q6IC98 578 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM92Q6UXU6 159 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 ALLCQ8N6M5 410 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 TSTD1Q8NFU3 115 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 SHC3Q92529 594 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 PARD6AQ9NPB6 346 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 SGK1O00141 431 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 GFRA2O00451 464 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 TRIM24O15164 1050 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 FBXO21O94952 628 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 LATS1O95835 1130 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.513e-10■■■□□ 15.4
C9orf3-215ENST00000478473 PON1P27169 355 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 MAN2A1Q16706 1144 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 TPGS1Q6ZTW0 290 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 CEP68Q76N32 757 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 BEND5Q7L4P6 421 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC33Q8N5R6 958 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 DLL3Q9NYJ7 618 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 SPAG17Q6Q759 2223 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 SLC12A8A0AV02 714 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 BECN2A8MW95 431 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 TIE1P35590 1138 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 LPAL2Q16609 132 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 RNF139Q8WU17 664 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 SIX2Q9NPC8 291 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 MED7O43513 233 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 CALCAP01258 141 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 IGLV3-27P01718 113 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 LCP1P13796 627 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 ID4P47928 161 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 RGS7P49802 495 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 LMNB2Q03252 620 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 CSRP2Q16527 193 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 KBTBD6Q86V97 674 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 C11orf74Q86VG3 221 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 DENND1CQ8IV53 801 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 CACNA1AO00555 2505 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 PRRT4C9JH25 899 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 SART1O43290 800 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 EPN2O95208 641 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 KRT5P13647 590 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 ACADSBP45954 432 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 DGKGP49619 791 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF445P59923 1031 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 ARHGAP8P85298 464 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 RING1Q06587 406 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 PLK5Q496M5 336 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 MIIPQ5JXC2 388 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 GJB7Q6PEY0 223 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM110Q86TL2 294 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 MDGA1Q8NFP4 955 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 EDEM1Q92611 657 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 RMDN1Q96DB5 314 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 GBP4Q96PP9 640 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 SLC2A11Q9BYW1 496 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 NDST4Q9H3R1 872 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 CD248Q9HCU0 757 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa24.47■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 ALDH1A2O94788 518 aa24.46■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 LTFP02788 710 aa24.46■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 FYNP06241 537 aa24.46■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 HMBSP08397 361 aa24.46■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 VWA3BQ502W6 1294 aa24.46■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 RNF43Q68DV7 783 aa24.46■■□□□ 1.51
C9orf3-215ENST00000478473 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms