RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468747.5

FAM107B-211, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM107B, Length 2,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM107B-211ENST00000468747 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 OCEL1Q9H607 264 aa23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 CDK7P50613 346 aa23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 RALGPS1Q5JS13 557 aa23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 LPCAT4Q643R3 524 aa23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 CRLF3Q8IUI8 442 aa23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 WDR49Q8IV35 697 aa23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 USP6NLQ92738 828 aa23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.16■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 HMX2A2RU54 273 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 RAP1GAPP47736 663 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 SFT2D3Q587I9 215 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 NLRP4Q96MN2 994 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 OGTO15294 1046 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 SNNO75324 88 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 ERBB2P04626 1255 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 OSTNP61366 133 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 MROH9Q5TGP6 573 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 ARHGAP42A6NI28 874 aa23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 B4GALT5O43286 388 aa23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 PPIL2Q13356 520 aa23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 APOL6Q9BWW8 343 aa23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 GPAMQ9HCL2 828 aa23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 S100A14Q9HCY8 104 aa23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 SBF1O95248 1867 aa23.14■■□□□ 1.3
FAM107B-211ENST00000468747 SDR42E2A6NKP2 422 aa23.14■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 SERPINA6P08185 405 aa23.14■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 GRIA2P42262 883 aa23.14■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 NOMO1Q15155 1222 aa23.14■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 NDUFAF2Q8N183 169 aa23.14■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF778Q96MU6 729 aa23.14■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa23.14■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 USP18Q9UMW8 372 aa23.14■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 H7C0C1 242 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 SPAG6O75602 509 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 BPGMP07738 259 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 SPATA31D3P0C874 917 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 CCNFP41002 786 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 ASPAP45381 313 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 ATP5OP48047 213 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 CLCN3P51790 818 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 SESTD1Q86VW0 696 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 RASSF3Q86WH2 238 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 XYLT1Q86Y38 959 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 OR6Y1Q8NGX8 325 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 USP29Q9HBJ7 922 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 SOX13Q9UN79 622 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 ITM2AO43736 263 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 PDE5AO76074 875 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 PDSS2Q86YH6 399 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 TRIM42Q8IWZ5 723 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.13■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 CHADO15335 359 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 EPHB1P54762 984 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 DUOXA2Q1HG44 320 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 DHDDSQ86SQ9 333 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 NCSTNQ92542 709 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 KCNN4O15554 427 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 OSBPP22059 807 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 AP3M2P53677 418 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 CDH6P55285 790 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 TUBB3Q13509 450 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 HIC1Q14526 733 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.12■■□□□ 1.29
FAM107B-211ENST00000468747 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms