RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 SATB1Q01826 763 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SYCP1Q15431 976 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TPGS1Q6ZTW0 290 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM110Q86TL2 294 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM25Q86YD3 366 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 DENND1CQ8IV53 801 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 NEK11Q8NG66 645 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ACDQ96AP0 544 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SPAG5Q96R06 1193 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 BBS2Q9BXC9 721 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 GANQ9H2C0 597 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SEMA4AQ9H3S1 761 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 MARK1Q9P0L2 795 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 DEC1Q9P2X7 70 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CAPN9O14815 690 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 KAT7O95251 611 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 KLKB1P03952 638 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 NCAM1P13591 858 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CYP11B1P15538 503 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 GRIA2P42262 883 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC6A11P48066 632 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 KLK7P49862 253 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TPM4P67936 248 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 KDSRQ06136 332 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TSSK4Q6SA08 328 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 BEND5Q7L4P6 421 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 C12orf40Q86WS4 652 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 NAT16Q8N8M0 369 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 PHOX2BQ99453 314 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 FUCA2Q9BTY2 467 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SYNCQ9H7C4 482 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SIK3Q9Y2K2 1263 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 R4GN57 208 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SPTBN4Q9H254 2564 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 USP34Q70CQ2 3546 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM186AA6NE01 2351 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CFAP54Q96N23 3096 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 CACNG3O60359 315 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 TULP3O75386 442 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 LATS1O95835 1130 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 CYBBP04839 570 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP1A3P13637 1013 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 TYRP14679 529 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF445P59923 1031 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 GRAMD4Q6IC98 578 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 UNC45BQ8IWX7 931 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 CPXM2Q8N436 756 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 SERPINB11Q96P15 392 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 CPXM1Q96SM3 734 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 POPDC2Q9HBU9 364 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 EML5Q05BV3 1969 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 VPS13AQ96RL7 3174 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 TBC1D3BA6NDS4 549 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 K7EQS6 105 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 MSI1O43347 362 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 GFPT2O94808 682 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 CAVIN2O95810 425 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 GLI1P08151 1106 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 TDGF1P13385 188 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 SOX5P35711 763 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 STAT1P42224 750 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 TNFRSF4P43489 277 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 SEC13P55735 322 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 TBX4P57082 545 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 RING1Q06587 406 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 NNTQ13423 1086 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP1-205ENST00000466097 EFHC1Q5JVL4 640 aa15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.7 ms