RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	MGST3	O14880	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	COQ9	O75208	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	HAUS5	O94927	633 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ALOX12	P18054	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ATIC	P31939	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	WNT3	P56703	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006		H7C4K7	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	DOK2	O60496	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NTSR2	O95665	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CHEK2	O96017	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CYP2C9	P11712	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	FCER1A	P12319	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	AKR1B1	P15121	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC5A2	P31639	672 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	AKT1	P31749	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	MCM2	P49736	904 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CCR9	P51686	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	C21orf58	P58505	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZBED6	P86452	979 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	INSC	Q1MX18	579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	USP37	Q86T82	979 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	LNX2	Q8N448	690 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PNKP	Q96T60	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	DERA	Q9Y315	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	MASP2	O00187	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TOR1B	O14657	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	P4HA2	O15460	535 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TSPAN3	O60637	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	KRT38	O76015	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	VIP	P01282	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CSF1	P09603	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	VIPR2	P41587	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CUL4A	Q13619	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PSMD6	Q15008	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms