RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PHF21BQ96EK2 531 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 DPH1Q9BZG8 443 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 MYO6Q9UM54 1294 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 HOXC6P09630 235 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 GALNSP34059 522 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 WDR5P61964 334 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 RAB1AP62820 205 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 DLGAP5Q15398 846 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 UEVLDQ8IX04 471 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 STEAP1Q9UHE8 339 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.56□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 CA12O43570 354 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 NPR1P16066 1061 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 AKAP5P24588 427 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 IDUAP35475 653 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 RFX2P48378 723 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 DDR1Q08345 913 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 MAP3K14Q99558 947 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.55□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 DOCK7Q96N67 2140 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A1B0GUV1 79 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 H7C4K7 107 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 RRP9O43818 475 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 CHRNB1P11230 501 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 ITGA8P53708 1063 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 ERVFC1-1P60608 527 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PRSS57Q6UWY2 283 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 SKAP1Q86WV1 359 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 SPSB4Q96A44 273 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 CDT1Q9H211 546 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 VPS45Q9NRW7 570 aa4.54□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A1W2PPL8 197 aa4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 CCP110O43303 1012 aa4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 AP1G1O43747 822 aa4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 ART1P52961 327 aa4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM240Q5SV17 173 aa4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 LCE1FQ5T754 118 aa4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 USP49Q70CQ1 688 aa4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 HPS3Q969F9 1004 aa4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 CDCP1Q9H5V8 836 aa4.53□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 CKAP5Q14008 2032 aa4.52□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 A6NNC1 897 aa4.52□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 PIAS2O75928 621 aa4.52□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 KITP10721 976 aa4.52□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.52□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 OR56A3Q8NH54 315 aa4.52□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 KCNG2Q9UJ96 466 aa4.52□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 BTBD18B2RXH4 712 aa4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 UMODP07911 640 aa4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 KLRC1P26715 233 aa4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 VPS41P49754 854 aa4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 STK3Q13188 491 aa4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 DNASE1L3Q13609 305 aa4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 CNGA3Q16281 694 aa4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 C6orf10Q5SRN2 563 aa4.51□□□□□ -1.69
USP9YP28-201ENST00000435142 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms