RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 CYP21A2P08686 494 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-205ENST00000427193 SBK3P0C264 359 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-205ENST00000427193 GATA3P23771 443 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-205ENST00000427193 SLC16A1P53985 500 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-205ENST00000427193 ANAPC15P60006 121 aa6.35□□□□□ -1.39
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C9orf3-205ENST00000427193 CLUL1Q15846 466 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-205ENST00000427193 SBK1Q52WX2 424 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-205ENST00000427193 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF365Q70YC5 407 aa6.35□□□□□ -1.39
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C9orf3-205ENST00000427193 SNX27Q96L92 541 aa6.35□□□□□ -1.39
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C9orf3-205ENST00000427193 ARMT1Q9H993 441 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-205ENST00000427193 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-205ENST00000427193 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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C9orf3-205ENST00000427193 ABCG1P45844 678 aa6.34□□□□□ -1.39
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C9orf3-205ENST00000427193 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
C9orf3-205ENST00000427193 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
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C9orf3-205ENST00000427193 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.34□□□□□ -1.39
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C9orf3-205ENST00000427193 FBXL16Q8N461 479 aa6.34□□□□□ -1.39
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C9orf3-205ENST00000427193 E7ENX8 843 aa6.33□□□□□ -1.4
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C9orf3-205ENST00000427193 C12orf60Q5U649 245 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 CTR9Q6PD62 1173 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.33□□□□□ -1.4
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C9orf3-205ENST00000427193 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.33□□□□□ -1.4
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C9orf3-205ENST00000427193 MCM8Q9UJA3 840 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
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C9orf3-205ENST00000427193 AK9Q5TCS8 1911 aa6.33□□□□□ -1.4
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C9orf3-205ENST00000427193 TOR1BO14657 336 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 ERBB2P04626 1255 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 CD1AP06126 327 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 NT5C2P49902 561 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 EVCP57679 992 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 NXPH1P58417 271 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 ITIH3Q06033 890 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 KIF22Q14807 665 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 INAVAQ3KP66 663 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 CNTD1Q8N815 330 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-205ENST00000427193 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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