RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 HIPK3Q9H422 1215 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 USP29Q9HBJ7 922 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAPPC3O43617 180 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC4O95801 387 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 GBE1Q04446 702 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 PCGF5Q86SE9 256 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 RELL1Q8IUW5 271 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 SCML4Q8N228 414 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ARL4AP40617 200 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 FAAP100Q0VG06 881 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 HOOK3Q86VS8 718 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 NDC80O14777 642 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 RBL1P28749 1068 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 GRIK1P39086 918 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC11A1P49279 550 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 C9orf72Q96LT7 481 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC9A7Q96T83 725 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 MARCH5Q9NX47 278 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 PLXNA3P51805 1871 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 SYN3O14994 580 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNN4O15554 427 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 CXCL10P02778 98 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 AMHP03971 560 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 NR1D1P20393 614 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 GAD2Q05329 585 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 CEP57Q86XR8 500 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF139Q8WU17 664 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 DDIT4Q9NX09 232 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 RRN3Q9NYV6 651 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 TLDC2A0PJX2 215 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 SMIM23A6NLE4 172 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 I6L893 689 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 TNFRSF10BO14763 440 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 ADRA1BP35368 520 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 MAGEA4P43358 317 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC5A3P53794 718 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM60Q495X7 471 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 EFHC2Q5JST6 749 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 NTAN1Q96AB6 310 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 B3GALT6Q96L58 329 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 H3BRJ5 948 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 CREB3O43889 395 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 ALDH2P05091 517 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP2C18P33260 490 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP1A2P50993 1020 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 SKOR1P84550 965 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 TLE2Q04725 743 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 RTP4Q96DX8 246 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.177e-7■■■■□ 20.8
SH3BP5-204ENST00000412806 CFAP69A5D8W1 941 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 NR2C2P49116 596 aa22.36■■□□□ 1.17
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