RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC174Q6PII3 467 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC30AQ86WT1 665 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 EID2BQ96D98 161 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 KAZALD1Q96I82 304 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 USP29Q9HBJ7 922 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM22K7EJ46 135 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SYT5O00445 386 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CTIFO43310 598 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 KLRK1P26718 216 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINF1P36955 418 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 GSTM5P46439 218 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PROK1P58294 105 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 NHLH1Q02575 133 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 BFSP2Q13515 415 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CSHL1Q14406 222 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PROSER3Q2NL68 480 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 P3H1Q32P28 736 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 MSANTD2Q6P1R3 559 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF788Q6ZQV5 615 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 GATAD2AQ86YP4 633 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 OR1N1Q8NGS0 311 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 NELL1Q92832 810 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC17Q96LX7 622 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 RMDN3Q96TC7 470 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 KATNAL1Q9BW62 490 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 FZD4Q9ULV1 537 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 BTBD19C9JJ37 291 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BNC9 293 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 M0QZQ0 153 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CLIC1O00299 241 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM38O00635 465 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TCEA3O75764 348 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ALADP13716 330 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP8P22894 467 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 GALNSP34059 522 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CHKAP35790 457 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM187BQ17R55 369 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ERAP2Q6P179 960 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CHSY1Q86X52 802 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC10Q8IXB1 793 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 NRSN1Q8IZ57 195 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 GALNT4Q8N4A0 578 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 RITA1Q96K30 269 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 LRFN1Q9P244 771 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 VPS4AQ9UN37 437 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC187A0A096LP49 1063 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TISP43B9A030 160 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ACKR2O00590 384 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 FCHO1O14526 889 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 FYB1O15117 783 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 GCATO75600 419 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CER1O95813 267 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 C1RP00736 705 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 GYS1P13807 737 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 JAK3P52333 1124 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBA4AP68366 448 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXO1Q12778 655 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 GRAMD1BQ3KR37 738 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 C4orf46Q504U0 113 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM65Q6PI78 240 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 HASPINQ8TF76 798 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms