RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 STT3BQ8TCJ2 826 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RUBCNQ92622 972 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RSC1A1Q92681 617 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SARAFQ96BY9 339 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHFRQ96EP1 664 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MACROD1Q9BQ69 325 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ISCA1Q9BUE6 129 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLK15Q9H2R5 256 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP29Q9HBJ7 922 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRDM8Q9NQV8 689 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASB6Q9NWX5 421 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH3BP4Q9P0V3 963 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 INSL6Q9Y581 213 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMX3A6NHT5 357 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF28PB7ZC32 967 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF213O14771 459 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 IRAK2O43187 625 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUV39H1O43463 412 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP6R2O75170 966 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CER1O95813 267 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLPIP03973 132 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MATN1P21941 496 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP8P22894 467 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITPKBP27987 946 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 COPB1P53618 953 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNJ12Q14500 433 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 POSTNQ15063 836 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFRKBQ6P4R8 1299 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRABD2AQ86V40 505 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF25Q86VW2 580 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYRIPQ8NFW9 859 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR150Q8NGU9 434 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAR2Q96K12 515 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX18Q96RF0 628 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGAP2Q99490 1192 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIMP4Q99727 224 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHMP4AQ9BY43 222 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 IKZF4Q9H2S9 585 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLXIPQ9HAP2 919 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 H7C1Q1 480 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CREB3O43889 395 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAMEF2O60811 474 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCATO75600 419 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 JTBO76095 146 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHRS4L1P0CG22 281 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALADP13716 330 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALNSP34059 522 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 THBS4P35443 961 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RENBPP51606 427 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 JAK3P52333 1124 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNLIPRP1P54315 467 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPC5P78333 572 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 BIRC3Q13489 604 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNASE1L3Q13609 305 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNB1Q14721 858 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS6KA2Q15349 733 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM60Q495X7 471 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 STRIP1Q5VSL9 837 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD40Q6AI12 368 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms