RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCTD5Q9NXV2 234 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 FZD1Q9UP38 647 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 TESMINQ9Y4I5 508 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 SCINQ9Y6U3 715 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ITIH6Q6UXX5 1313 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC187A0A096LP49 1063 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 SAC3D1A6NKF1 404 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 PSMD9O00233 223 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 TSPAN3O60637 253 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 PMPCBO75439 489 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 TJP3O95049 919 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 NXPH3O95157 252 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 TBX18O95935 607 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ONECUT2O95948 504 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ALADP13716 330 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 HOXA5P20719 270 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADRA1DP25100 572 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ITPKBP27987 946 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 CTGFP29279 349 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 THBS4P35443 961 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPL15P61313 204 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 E2F1Q01094 437 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 DEUP1Q05D60 604 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEMA3BQ13214 749 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTPRRQ15256 657 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDSNQ15517 529 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM187BQ17R55 369 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 CTXN3Q4LDR2 81 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF569Q5MCW4 686 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIAA0895LQ68EN5 471 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 C16orf89Q6UX73 402 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARHGEF19Q8IW93 802 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 EXTL1Q92935 676 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 RFKQ969G6 155 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 LENG9Q96B70 501 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 HVCN1Q96D96 273 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAR2Q96K12 515 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 PBKQ96KB5 322 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRR25Q96S07 402 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ALG8Q9BVK2 526 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 SERHL2Q9H4I8 314 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 JMJD4Q9H9V9 463 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLEKHA2Q9HB19 425 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 EHD3Q9NZN3 535 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 DKK3Q9UBP4 350 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIPSLA2A3N6 862 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 K7ESM1 405 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 YY2O15391 372 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 NKX2-8O15522 239 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 KLK10O43240 276 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 CA12O43570 354 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMPRSS11DO60235 418 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 PEX11BO96011 259 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHRM2P08172 466 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 CYP3A4P08684 503 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 CSF1P09603 554 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ITGAMP11215 1152 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 CREB1P16220 341 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 MMP8P22894 467 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 TPTEP56180 551 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 FOXL2P58012 376 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 TLE3Q04726 772 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 BFSP2Q13515 415 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNASE1L3Q13609 305 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 BMPR2Q13873 1038 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 TXNRD1Q16881 649 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 NBPF8Q3BBV2 869 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 TIGD2Q4W5G0 525 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 WDR45BQ5MNZ6 344 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ABHD17BQ5VST6 288 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKRD40Q6AI12 368 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANO7Q6IWH7 933 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 MZT2BQ6NZ67 158 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 DSTYKQ6XUX3 929 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTCHD4Q6ZW05 846 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 P3H2Q8IVL5 708 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-655P-201ENST00000362858 C1orf210Q8IVY1 113 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms