RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF558Q96NG5 402 aa16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 FBXO44Q9H4M3 255 aa16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 WHRNQ9P202 907 aa16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF148Q9UQR1 794 aa16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 SOD2P04179 222 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 LAG3P18627 525 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ADRA1BP35368 520 aa16.07■□□□□ 0.16
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LIMS1-202ENST00000338045 CXCR3P49682 368 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 GPR15P49685 360 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF365Q70YC5 407 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ART4Q93070 314 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 SPATA17Q96L03 361 aa16.07■□□□□ 0.16
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LIMS1-202ENST00000338045 FMO2Q99518 471 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 DDIT4Q9NX09 232 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ASIC3Q9UHC3 531 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
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LIMS1-202ENST00000338045 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ITIH2P19823 946 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 PLTPP55058 493 aa16.06■□□□□ 0.16
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LIMS1-202ENST00000338045 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 PSMD5Q16401 504 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 FAM117BQ6P1L5 589 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 TAC4Q86UU9 113 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 MON1AQ86VX9 555 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ADAM32Q8TC27 787 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 P3H4Q92791 437 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 PLXNA3P51805 1871 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 I6L893 689 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ADAM12O43184 909 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 KRT14P02533 472 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 PGFP49763 221 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ROR1Q01973 937 aa16.05■□□□□ 0.16
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LIMS1-202ENST00000338045 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
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LIMS1-202ENST00000338045 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 SNF8Q96H20 258 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 FAM204AQ9H8W3 233 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 NMUR1Q9HB89 426 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ANLNQ9NQW6 1124 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 COMMD8Q9NX08 183 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.162e-8■■□□□ 13.8
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LIMS1-202ENST00000338045 COX16Q9P0S2 106 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 WDR27A2RRH5 827 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 MCF2LO15068 1137 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ATF2P15336 505 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 ARL4AP40617 200 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 USP46P62068 366 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 DSG1Q02413 1049 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 SEMA3BQ13214 749 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 NPNTQ6UXI9 565 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 OTOP2Q7RTS6 562 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 LRRC45Q96CN5 670 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM169Q96HH4 297 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 CEP295NLQ96MC4 621 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 PCDH9Q9HC56 1237 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 PTPRSQ13332 1948 aa16.04■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 IRAK2O43187 625 aa16.04■□□□□ 0.16
LIMS1-202ENST00000338045 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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