RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268717.9

COPS3-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS3, Length 1,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-201ENST00000268717 ZNF280DQ6N043 979 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 ZDHHC24Q6UX98 284 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 ALLCQ8N6M5 410 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 ART4Q93070 314 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 CCDC114Q96M63 670 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 RNF157Q96PX1 679 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 CALN1Q9BXU9 219 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 NEUROG2Q9H2A3 272 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 MARCH5Q9NX47 278 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 DNPEPQ9ULA0 475 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 SNX24Q9Y343 169 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 BRWD1Q9NSI6 2320 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 CARNS1A5YM72 827 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 LTFP02788 710 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 CD48P09326 243 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 TGM2P21980 687 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 MAGEA11P43364 429 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 SLC11A1P49279 550 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 SULT1E1P49888 294 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 CALCOCO2Q13137 446 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 DCAF6Q58WW2 860 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 SCYL2Q6P3W7 929 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 RFX6Q8HWS3 928 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 SNF8Q96H20 258 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 TMEM209Q96SK2 561 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 TRIM31Q9BZY9 425 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 RWDD3Q9Y3V2 267 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 YJEFN3A6XGL0 299 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 TBKBP1A7MCY6 615 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 E7ENQ6 273 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 PPFIA2O75334 1257 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 F9P00740 461 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 GALTP07902 379 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 IL4RP24394 825 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 IVDP26440 423 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 KLRC2P26717 231 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 RAB6CQ53S08 254 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 SLC9A4Q6AI14 798 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 FUT10Q6P4F1 479 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 TMC3Q7Z5M5 1100 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 ACTL9Q8TC94 416 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 PPM1EQ8WY54 764 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 NTAN1Q96AB6 310 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 C8orf48Q96LL4 319 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 ADAM33Q9BZ11 813 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 RAB6CQ9H0N0 254 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 ASIC3Q9UHC3 531 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 AP4E1Q9UPM8 1137 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 VCANP13611 3396 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 C5orf67F2Z3F1 127 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 H3BNC9 293 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 H7C4K7 107 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 CAPN9O14815 690 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 TRIM66O15016 1216 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 FYNP06241 537 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 ATF2P15336 505 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 L1CAMP32004 1257 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 CTNNB1P35222 781 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 BMPR1AP36894 532 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 PLTPP55058 493 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 SCAPQ12770 1279 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 SLC39A12Q504Y0 691 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 FBXO25Q8TCJ0 367 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 FOXP3Q9BZS1 431 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 LMCD1Q9NZU5 365 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 FZD10Q9ULW2 581 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS3-201ENST00000268717 XIRP2A4UGR9 3374 aa15.96■□□□□ 0.14
COPS3-201ENST00000268717 TNFRSF10BO14763 440 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS3-201ENST00000268717 MCF2LO15068 1137 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS3-201ENST00000268717 TBC1D4O60343 1298 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS3-201ENST00000268717 EFEMP2O95967 443 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS3-201ENST00000268717 RB1P06400 928 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS3-201ENST00000268717 USP17L7P0C7H9 530 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS3-201ENST00000268717 SLMAPQ14BN4 828 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS3-201ENST00000268717 NOMO1Q15155 1222 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS3-201ENST00000268717 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms