RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 GJB1P08034 283 aa21.96■■□□□ 1.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDK3Q15120 406 aa21.96■■□□□ 1.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 CA9Q16790 459 aa21.96■■□□□ 1.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 EML3Q32P44 896 aa21.96■■□□□ 1.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.96■■□□□ 1.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 OPTNQ96CV9 577 aa21.96■■□□□ 1.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.96■■□□□ 1.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLF11O14901 512 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 SIN3BO75182 1162 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 METTL18O95568 372 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 SERPINA6P08185 405 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP46P62068 366 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 CES3Q6UWW8 571 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 FRMD7Q6ZUT3 714 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACAD11Q709F0 780 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM192Q8IY95 271 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM81AQ8TBF8 368 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 CEP41Q9BYV8 373 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 VAV1P15498 845 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 CASC4Q6P4E1 433 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 APPL1Q9UKG1 709 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 E9PBE3 544 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 DCXO43602 365 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLHL41O60662 606 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASPAP45381 313 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADAM32Q8TC27 787 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLHL4Q9C0H6 718 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 SDCBP2Q9H190 292 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 RHBDL2Q9NX52 303 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 HACL1Q9UJ83 578 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1B0GTW7 788 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 GSRP00390 522 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 UQCRBP14927 111 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 RGS7P49802 495 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 PGGT1BP53609 377 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 LSAMPQ13449 338 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAPSQ13938 189 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOMO1Q15155 1222 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDH22Q9UJ99 828 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 EMCNQ9ULC0 261 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 POMPQ9Y244 141 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSAT1Q9Y617 370 aa21.94■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 APOEP02649 317 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 GTF2A2P52657 109 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 COPAP53621 1224 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATG7O95352 703 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAP3K10Q02779 954 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 FOLH1Q04609 750 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 TLR1Q15399 786 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM91A1Q658Y4 838 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 C10orf107Q8IVU9 208 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 DGKIO75912 1065 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBED1O96006 694 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASNSP08243 561 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC1A6P48664 564 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT81Q14533 505 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARPINQ7Z6K5 226 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.93■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 M0QYV0 167 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 IYDQ6PHW0 289 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNS4Q8IZW8 715 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRIP2Q9C0E4 1043 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 VCX3BQ9H321 246 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 VCX3AQ9NNX9 186 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms