RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ugp2Q91ZJ5 508 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chst7Q9EP78 484 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tcp11x2A2AEI7 503 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ssxb9A2BI93 185 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttll8A4Q9F1 832 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm8909G3UXE9 396 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il1rapl1P59823 695 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hoxb13P70321 286 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fscn2Q32M02 492 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PterQ60866 349 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HarsQ61035 509 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rcn2Q8BP92 320 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr809Q8VEX8 328 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr393Q8VGR6 312 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdh18Q8VHR0 1134 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrp8Q924X6 996 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ogfod2Q9CQ04 349 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 StambpQ9CQ26 424 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa21.39■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kpna7C0LLJ0 499 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lilra5D3Z7A9 295 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gimd1E9PW74 217 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp4f40G3UW81 524 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gnat1P20612 350 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ItgalP24063 1163 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Oaz1P54369 227 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl26P61255 145 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Npas2P97460 816 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hsdl2Q2TPA8 490 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ddx4Q61496 702 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc26a2Q62273 739 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gucy2gQ6TL19 1100 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Exoc3l1Q8BI71 739 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mettl21cQ8BLU2 248 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc159Q8C963 411 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mcoln2Q8K595 566 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tasp1Q8R1G1 420 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cpt1bQ924X2 772 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Actr3Q99JY9 418 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc175E9PVB3 822 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrch2Q3UMG5 773 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fscn1Q61553 493 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tas2r109Q7M707 316 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrcpQ7TMR0 491 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LppQ8BFW7 613 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chmp2bQ8BJF9 213 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tlk1Q8C0V0 766 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Erich5Q8K0S2 362 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tspan17Q9D7W4 270 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dtwd1Q9D8U7 304 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PapolbQ9WVP6 641 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrriq4A6H6A4 596 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ift81O35594 676 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pms2P54279 859 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ikzf1Q03267 517 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atg9bQ6EBV9 922 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr385Q8VGT1 312 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CarfQ8VHI4 689 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Haus8Q99L00 373 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nt5c3aQ9D020 331 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ap2b1Q9DBG3 937 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Efcab12V9GXH0 673 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1305A2AVW3 312 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sstr3P30935 428 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Crhr1P35347 415 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GsrP47791 500 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SnnP61807 88 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 McuQ3UMR5 350 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Grik1Q60934 836 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Avpr1aQ62463 423 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RetsatQ64FW2 609 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rhpn2Q8BWR8 686 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam151aQ8QZW3 608 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Oma1Q9D8H7 521 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pidd1Q9ERV7 915 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prl2a1Q9JHK0 228 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dclre1aQ9JIC3 1026 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NumbQ9QZS3 653 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Apold1E9Q0X2 246 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SmgcF6VRN1 385 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zc3h12bG3X9I7 835 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kpna6O35345 536 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cbfa2t2O70374 594 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mmp3P28862 477 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mxi1P50540 228 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdh8P97291 799 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcnq1P97414 668 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smyd1P97443 490 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpina6Q06770 397 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.6 ms