RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000017743.2

Krt20-201, Transcript of Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Krt20, Length 1,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20-201ENSMUST00000017743 Rasgrf1P27671 1262 aa14.91□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Tmem45aQ60774 273 aa14.91□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Slc6a4Q60857 630 aa14.91□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Runx3Q64131 409 aa14.91□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Impg2Q80XH2 1243 aa14.91□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Haus1Q8BHX1 278 aa14.91□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 EpgnQ924X1 152 aa14.91□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Tubb4aQ9D6F9 444 aa14.91□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Psmg1Q9JK23 289 aa14.91□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Igkv10-94A0A075B5L1 115 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Znf804aA2AKY4 1200 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Ces1bD3Z5G7 567 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Gm5415E9PXF3 478 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 NoctO35710 429 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Sox9Q04887 507 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Grik1Q60934 836 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Gpatch2lQ6PE65 482 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Ssxb10Q6XAR7 170 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 SpopQ6ZWS8 374 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Otop2Q80SX5 563 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Vmn1r188Q8K3N2 308 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Abcg8Q9DBM0 673 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Tubd1Q9R1K7 455 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Foxm1O08696 760 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Serpinb9O08797 374 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Ring1O35730 406 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 EomesO54839 707 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Zfy2P20662 777 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 CenpcP49452 906 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 AdkP55264 361 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 AxlQ00993 888 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Trappc9Q3U0M1 1148 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Wdr41Q3UDP0 460 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Tcf4Q60722 670 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Trim21Q62191 470 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 C1qtnf6Q6IR41 264 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Mib1Q80SY4 1006 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Rhot1Q8BG51 631 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Enpp4Q8BTJ4 456 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Nlrp4aQ8BU40 982 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Samd7Q8C8Y5 445 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Cox18Q8VC74 331 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Caskin2Q8VHK1 1201 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Epn3Q91W69 636 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Sytl2Q99N50 950 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Trpc7Q9WVC5 862 aa14.9□□□□□ -0.02
Krt20-201ENSMUST00000017743 Col4a4Q9QZR9 1682 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Frem3Q5H8B9 2123 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Arhgap42B2RQE8 841 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Lipo2D3YY49 398 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Apold1E9Q0X2 246 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 F6Y6L6 278 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 PrlP06879 226 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Bmp8aP34821 399 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 SykP48025 629 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Brms1lQ3U1T3 323 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 TceancQ3US16 359 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Syne3Q4FZC9 975 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Hepacam2Q4VAH7 463 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Slc39a10Q6P5F6 833 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Krit1Q6S5J6 736 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Olfr867Q7TRF3 331 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Rnaseh2bQ80ZV0 308 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 DcakdQ8BHC4 231 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Btbd6Q8K2J9 488 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Art3Q8R2G4 371 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Ackr4Q924I3 350 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Abcg3Q99P81 650 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Dph5Q9CWQ0 281 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Kbtbd12Q9D618 625 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 DmgdhQ9DBT9 869 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Prl2a1Q9JHK0 228 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Asb3Q9WV72 525 aa14.89□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Gm14525B1AZA0 212 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Gm2012B1B0R1 212 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Pex5O09012 639 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 DffaO54786 331 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Soat2O88908 525 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 GlulP15105 373 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Ctnna1P26231 906 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 PtpaP58389 323 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Rab33aP97950 237 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 PrlrQ08501 608 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Tmc5Q32NZ6 967 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Elf3Q3UPW2 391 aa14.88□□□□□ -0.03
Krt20-201ENSMUST00000017743 Ctnna2Q61301 953 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.4 ms