RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631043.2

TCF4-275, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-275	ENST00000631043	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PFAS	O15067	1338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043		F8VZ95	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CLIC2	O15247	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PMM2	O15305	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	P4HA2	O15460	535 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	EXOC3	O60645	756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ERLIN1	O75477	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TPPP	O94811	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ABLIM3	O94929	683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	INMT	O95050	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MOCS3	O95396	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ACTN1	P12814	892 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	KRT13	P13646	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	FER	P16591	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MCM3	P25205	808 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PON1	P27169	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ICAM3	P32942	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ABCD1	P33897	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	RAD52	P43351	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MAGEA1	P43355	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	FMO5	P49326	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CASP4	P49662	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MXI1	P50539	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	GALK1	P51570	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CYP2J2	P51589	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CDR1	P51861	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	RTP1	P59025	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	GTF2B	Q00403	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SATB1	Q01826	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PRKCE	Q02156	737 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ITIH3	Q06033	890 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ENPEP	Q07075	957 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	BFSP1	Q12934	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	VGLL4	Q14135	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	COG2	Q14746	738 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	EPN3	Q9H201	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms