RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620706.1

UBXN8-210, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-210ENST00000620706 CEP83Q9Y592 693 aa9.61□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 MYO1FO00160 1098 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 LILRB3O75022 631 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 TOM1L1O75674 476 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 PROSCO94903 275 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 ASS1P00966 412 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 MYZAPP0CAP1 466 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 NR1D1P20393 614 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CXCL12P48061 93 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 SLC26A2P50443 739 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CCR3P51677 355 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 GNGT1P63211 74 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 SATB1Q01826 763 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 MCL1Q07820 350 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 FZD5Q13467 585 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 LIN9Q5TKA1 542 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CROCCP2Q86T23 111 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CPNE8Q86YQ8 564 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 VPS52Q8N1B4 723 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 MDM1Q8TC05 714 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 ART4Q93070 314 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 BTBD6Q96KE9 485 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 DPH5Q9H2P9 285 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 GOLGA6L10A6NI86 522 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 OGTO15294 1046 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CLDN3O15551 220 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 ASAP2O43150 1006 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 PSTPIP1O43586 416 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 KIAA0754O94854 1291 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 LGALS2P05162 132 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 RRM1P23921 792 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 KLRC2P26717 231 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 GNA15P30679 374 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 NSFP46459 744 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 MNAT1P51948 309 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 PMS2P54278 862 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 POU5F1BQ06416 359 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 NCOA4Q13772 614 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 PLCB4Q15147 1175 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 SPOPLQ6IQ16 392 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 PARM1Q6UWI2 310 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 LONP2Q86WA8 852 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 FGF14Q92915 247 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 TLCD1Q96CP7 247 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 C18orf8Q96DM3 657 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 FZD8Q9H461 694 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 AZI2Q9H6S1 392 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 WHRNQ9P202 907 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 SNX24Q9Y343 169 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-210ENST00000620706 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms