RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 TPM2P07951 284 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 KLHL40Q2TBA0 621 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 FBXO43Q4G163 708 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 BSPRYQ5W0U4 402 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 DENND1BQ6P3S1 775 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 Q6ZNB5 142 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 FAM71AQ8IYT1 594 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 VPS16Q9H269 839 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 PLCB1Q9NQ66 1216 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 ABCC13Q9NSE7 274 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 MARCH2Q9P0N8 246 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 RASAL2Q9UJF2 1139 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 EGFP01133 1207 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 ADH5P11766 374 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 ZNF18P17022 549 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 PTK2Q05397 1052 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 LY6G5CQ5SRR4 150 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 SPHK2Q9NRA0 654 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 STRIP2Q9ULQ0 834 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 PCDHGC3Q9UN70 934 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 FHOD1Q9Y613 1164 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 UCHL3P15374 230 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 CLCN1P35523 988 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 ACADSBP45954 432 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 GAD2Q05329 585 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 PPP2R5DQ14738 602 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 NFKBIBQ15653 356 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 NELL1Q92832 810 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 SLC4A5Q9BY07 1137 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 ZNF510Q9Y2H8 683 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 LRRC10BA6NIK2 292 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 CXCL12P48061 93 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
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PMS1-220ENST00000618056 RNF139Q8WU17 664 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 DCLK3Q9C098 648 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 PIK3R2O00459 728 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 TDGF1P13385 188 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 PTMSP20962 102 aa26.04■■□□□ 1.76
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PMS1-220ENST00000618056 RAPGEF1Q13905 1077 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 FKBP15Q5T1M5 1219 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 TMEM110Q86TL2 294 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 TMEM25Q86YD3 366 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 CLEC4CQ8WTT0 213 aa26.04■■□□□ 1.76
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PMS1-220ENST00000618056 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
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PMS1-220ENST00000618056 MSANTD2Q6P1R3 559 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 SLC47A2Q86VL8 602 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa26.04■■□□□ 1.76
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PMS1-220ENST00000618056 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 FRYLO94915 3013 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 SLC12A8A0AV02 714 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 ATG13O75143 517 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 RNF40O75150 1001 aa26.03■■□□□ 1.76
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PMS1-220ENST00000618056 C12orf40Q86WS4 652 aa26.03■■□□□ 1.76
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PMS1-220ENST00000618056 SCUBE3Q8IX30 993 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA1Q92805 767 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 PNKPQ96T60 521 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 GANQ9H2C0 597 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 SEMA4AQ9H3S1 761 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 ZSCAN32Q9NX65 697 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 A0A0A0MRY4 1105 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 LGALS16A8MUM7 142 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
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