RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 LRRC31Q6UY01 552 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 LBX2Q6XYB7 198 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 HOOK3Q86VS8 718 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 GPC2Q8N158 579 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 DEPTORQ8TB45 409 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 SEMA4DQ92854 862 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 SLCO2A1Q92959 643 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 CD101Q93033 1021 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 FMO2Q99518 471 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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CLTC-211ENST00000579815 NUP85Q9BW27 656 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PORCNQ9H237 461 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 ZNF302Q9NR11 478 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 AMACRQ9UHK6 382 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 COG5Q9UP83 839 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PLAAQ9Y263 795 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 NUDT19A8MXV4 375 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 TULP2O00295 520 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 NDC80O14777 642 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 TTI1O43156 1089 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PSTPIP1O43586 416 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 SPOPO43791 374 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 CD3EP07766 207 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 MMEP08473 750 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 NUDT17P0C025 328 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 FAM153BP0C7A2 387 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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CLTC-211ENST00000579815 COMTP21964 271 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 ARL2P36404 184 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 USP8P40818 1118 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PIK3CAP42336 1068 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 GJA8P48165 433 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PEX5P50542 639 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 GUCY2FP51841 1108 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 EFNA5P52803 228 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 GNGT1P63211 74 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PPP2R5DQ14738 602 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 SLMAPQ14BN4 828 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 FAM153CQ494X1 144 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 MTERF2Q49AM1 385 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 LIN9Q5TKA1 542 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 SRLQ86TD4 932 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PALB2Q86YC2 1186 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 JAMLQ86YT9 394 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLTC-211ENST00000579815 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 TCP11Q8WWU5 503 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 SAAL1Q96ER3 474 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 SHDQ96IW2 340 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 WNK4Q96J92 1243 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 FGD4Q96M96 766 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 CGRRF1Q99675 332 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-211ENST00000579815 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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