RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	NCK2	O43639	380 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	TUBB4A	P04350	444 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CYP2D6	P10635	497 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	EGR1	P18146	543 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PSG6	Q00889	435 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	FOXF2	Q12947	444 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEMA3B	Q13214	749 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATP1A4	Q13733	1029 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNB1	Q14721	858 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHSY1	Q86X52	802 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	AGPS	O00116	658 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPP6C	O00743	305 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	DSCR3	O14972	297 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	NDST3	O95803	873 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	GLP2R	O95838	553 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	DRD1	P21728	446 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	GABRB3	P28472	473 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	HSPA7	P48741	367 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	BFSP2	Q13515	415 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CBFB	Q13951	182 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CSHL1	Q14406	222 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	STARD3	Q14849	445 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACOX1	Q15067	660 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	MUL1	Q969V5	352 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	HIC2	Q96JB3	615 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SGCZ	Q96LD1	299 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM234B	A2RU67	622 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787		H3BNC9	293 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLIC1	O00299	241 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADAMTS3	O15072	1205 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	SETSIP	P0DME0	302 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	MST1	P26927	711 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	JAK3	P52333	1124 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	ANO7	Q6IWH7	933 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	RANBP10	Q6VN20	620 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	TISP43	B9A030	160 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLA2G6	O60733	806 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	ABCB4	P21439	1286 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	MATN1	P21941	496 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	MCM5	P33992	734 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	PROK1	P58294	105 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	TFF2	Q03403	129 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	DNASE1L3	Q13609	305 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	UBE4A	Q14139	1066 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNJ12	Q14500	433 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	MPEG1	Q2M385	716 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	CUL5	Q93034	780 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	RITA1	Q96K30	269 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	C5orf34	Q96MH7	638 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	FZD4	Q9ULV1	537 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A087WZ62	844 aa		5.69	□□□□□ -1.5

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