RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549101.1

USP15-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-211ENST00000549101 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 GABRB3P28472 473 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 NEK3P51956 506 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 GPC5P78333 572 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 PMS2P11Q13670 270 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ZNF626Q68DY1 528 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 KAZALD1Q96I82 304 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.52□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 RASA4BC9J798 803 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 RASA4O43374 803 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 MST1P26927 711 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 PBX1P40424 430 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 AK2P54819 239 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 GPS1Q13098 491 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 PICALMQ13492 652 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 RANBP10Q6VN20 620 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 P3H2Q8IVL5 708 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 CCDC138Q96M89 665 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 WDR24Q96S15 920 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 VPS45Q9NRW7 570 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 FZD4Q9ULV1 537 aa6.51□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 FYB1O15117 783 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 PRAMEF2O60811 474 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 CBFA2T3O75081 653 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 IDEP14735 1019 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 DNASE1L3Q13609 305 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 KCNB1Q14721 858 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 OR2C3Q8N628 320 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ZNF398Q8TD17 642 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 RGL1Q9NZL6 768 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 FNIP2Q9P278 1114 aa6.5□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 SLC5A2P31639 672 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ARHGAP25P42331 645 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 KCNJ12Q14500 433 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 CCDC181Q5TID7 509 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 VSTM1Q6UX27 236 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 KRT73Q86Y46 540 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ZNF566Q969W8 418 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 MYD88Q99836 296 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.49□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 FAM234BA2RU67 622 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 EGR1P18146 543 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 GALNSP34059 522 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 DGKQP52824 942 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 SLC14A1Q13336 389 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ATP1A4Q13733 1029 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 SEC23BQ15437 767 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 MAP9Q49MG5 647 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 CNGA4Q8IV77 575 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ZNF778Q96MU6 729 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 OR2W5A6NFC9 320 aa6.47□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.47□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 FCHO1O14526 889 aa6.47□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 DRD1P21728 446 aa6.47□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP15-211ENST00000549101 ZNF81P51508 661 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms