RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXN1	O15353	648 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RGS10	O43665	173 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	MFAP3L	O75121	409 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	VIP	P01282	170 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	CSF1R	P07333	972 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	HGF	P14210	728 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	NTSR1	P30989	418 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ELF1	P32519	619 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TSPAN7	P41732	249 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	NR1H2	P55055	460 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTR2	P61160	394 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	NHLH2	Q02577	135 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	COL10A1	Q03692	680 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TLE2	Q04725	743 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	GPS1	Q13098	491 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308		Q6ZRM9	215 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS16	Q9H269	839 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	C3	P01024	1663 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	PLCH2	O75038	1416 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	NPAT	Q14207	1427 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF185	O15231	689 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP6R2	O75170	966 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TAF5L	O75529	589 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFPL1	O95159	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TBX18	O95935	607 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNA2	P16389	499 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	XBP1	P17861	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RXRA	P19793	462 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	FGFR4	P22455	802 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	AKT1	P31749	480 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67	5e-21	■□□□□ 9.8
SNHG1-222	ENST00000545308	RABGGTB	P53611	331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKAG1	P54619	331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	HSD11B2	P80365	405 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	AGL	P35573	1532 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CPS1	P31327	1500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GTW7	788 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308		E7ENX8	843 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT38	O76015	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ELANE	P08246	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ADORA2A	P29274	412 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TAP2	Q03519	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	OCA2	Q04671	838 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE3A	Q05086	875 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CHRND	Q07001	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPK7	Q13164	816 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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