RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 GNAT1P11488 350 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 RGS2P41220 211 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 GBE1Q04446 702 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SPARCL1Q14515 664 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SLC1A5Q15758 541 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 STRADAQ7RTN6 431 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PIGZQ86VD9 579 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 KBTBD13C9JR72 458 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 AVILO75366 819 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 RASSF9O75901 435 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 C1QAP02745 245 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 GSTA1P08263 222 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 KRT4P19013 534 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 MATKP42679 507 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 XRCC4Q13426 336 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ZFP42Q96MM3 310 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CYTH2Q99418 400 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 DUSP16Q9BY84 665 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CENPFP49454 3210 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 MYADML2A6NDP7 307 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 GABRDO14764 452 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 BEST1O76090 585 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CA4P22748 312 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 MSH2P43246 934 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 NR2C2P49116 596 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PDK4Q16654 411 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 FAXCQ5TGI0 409 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 BNIPLQ7Z465 357 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 KLC2Q9H0B6 622 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CYB561D2O14569 222 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SPAG6O75602 509 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 FAM163BP0C2L3 166 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ADIGQ0VDE8 80 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 WSCD1Q658N2 575 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 DEFB106AQ8N104 65 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 NT5C3BQ969T7 300 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CLDN5O00501 218 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 DAB1O75553 588 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 GCATO75600 419 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 TOMM70O94826 608 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 NPR3P17342 541 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 MAGEA3P43357 314 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 GALNTL6Q49A17 601 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 C4orf22Q6V702 233 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 MCUQ8NE86 351 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 TRPV1Q8NER1 839 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SPOCK2Q92563 424 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 DTLQ9NZJ0 730 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 FZD10Q9ULW2 581 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ZWINTO95229 277 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 METTL18O95568 372 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 APRTP07741 180 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 AKR1A1P14550 325 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 GOT1P17174 413 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms