RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533259.1

PDE4DIP-231, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 4

Gene PDE4DIP, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CLDN5	O00501	218 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TRIM66	O15016	1216 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	AP5Z1	O43299	807 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RHOBTB1	O94844	696 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CYP17A1	P05093	508 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PPP3CC	P48454	512 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PDE6C	P51160	858 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DGKE	P52429	567 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CDH8	P55286	799 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SEC13	P55735	322 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SHC2	P98077	582 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TAF10	Q12962	218 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DHCR24	Q15392	516 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SARM1	Q6SZW1	724 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DRC7	Q8IY82	874 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LMO3	Q8TAP4	145 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CPQ	Q9Y646	472 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	AKAP13	Q12802	2813 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CACNA1E	Q15878	2313 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TNFRSF10B	O14763	440 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KCNK5	O95279	499 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CD58	P19256	250 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BCKDHB	P21953	392 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ANXA13	P27216	316 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	USP8	P40818	1118 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MFAP3	P55082	362 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CREB5	Q02930	508 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ELF2	Q15723	593 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CRY1	Q16526	586 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ST3GAL2	Q16842	350 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	EMC10	Q5UCC4	262 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PMS2CL	Q68D20	193 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GJB7	Q6PEY0	223 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	C12orf40	Q86WS4	652 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	IL37	Q9NZH6	218 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	EHD2	Q9NZN4	543 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259		A0A1W2PQC6	194 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	C4orf47	A7E2U8	309 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GIPC1	O14908	333 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ADCY5	O95622	1261 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ABL1	P00519	1130 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KRT5	P13647	590 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KCNA4	P22459	653 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF75D	P51815	510 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CUL2	Q13617	745 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FAM81B	Q96LP2	452 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PNKP	Q96T60	521 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARID3A	Q99856	593 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NUP58	Q9BVL2	599 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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