RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516986.1

RNU6-56P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 56, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-56P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-56P-201ENST00000516986 FSCN2O14926 492 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 FANCGO15287 622 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ZSCAN12O43309 604 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ADAM11O75078 769 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ZPR1O75312 459 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 PTP4A3O75365 173 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 WBP4O75554 376 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 SUN1O94901 812 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 PAPLNO95428 1278 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 LARGE1O95461 756 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 APBA3O96018 575 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 IL1AP01583 271 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 GLAP06280 429 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 HSMCR30P0CW71 290 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 CKMT1AP12532 417 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 RARGP13631 454 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 TIMP2P16035 220 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 NPR1P16066 1061 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 NAGAP17050 411 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 BPIP17213 487 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ITGA2P17301 1181 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 KRT15P19012 456 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 PLCG1P19174 1290 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 PEX2P28328 305 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 CDC25CP30307 473 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 HLA-FP30511 346 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 GSTT1P30711 240 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 SLC7A1P30825 629 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 CCR1P32246 355 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ADRA1BP35368 520 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 IL15P40933 162 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ME1P48163 572 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 PITPNBP48739 271 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 POU3F4P49335 361 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 HARS2P49590 506 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 FHITP49789 147 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ADCY7P51828 1080 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ERVFC1P60507 584 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 IL2P60568 153 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 SRP54P61011 504 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 OCRLQ01968 901 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 GSTM4Q03013 218 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 SCN1BQ07699 218 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 CDC20Q12834 499 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 MAP4K2Q12851 820 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 LMAN2Q12907 356 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 TRAF2Q12933 501 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 GPS1Q13098 491 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 NNTQ13423 1086 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 GPM6BQ13491 265 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 DGCR6Q14129 220 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 NR1D2Q14995 579 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 SEC23AQ15436 765 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 GRIK5Q16478 980 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ZNF827Q17R98 1081 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 FAM110CQ1W6H9 321 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 FAM83EQ2M2I3 478 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ZACNQ401N2 412 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 CDONQ4KMG0 1287 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 CTXN3Q4LDR2 81 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 OXLD1Q5BKU9 147 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 PLAC9Q5JTB6 97 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 GLRA4Q5JXX5 417 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 CLVS2Q5SYC1 327 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ADGRF1Q5T601 910 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 TTC22Q5TAA0 569 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 CACHD1Q5VU97 1274 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 IL23RQ5VWK5 629 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ARHGAP17Q68EM7 881 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 ACAD10Q6JQN1 1059 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 KRT80Q6KB66 452 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 FBXL19Q6PCT2 694 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-56P-201ENST00000516986 TRAF7Q6Q0C0 670 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms