RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 SPHK2Q9NRA0 654 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-206ENST00000507253 ST7Q9NRC1 585 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-206ENST00000507253 YJEFN3A6XGL0 299 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 E7ENQ6 273 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 GREM1O60565 184 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 STC2O76061 302 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 OPRD1P41143 372 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 NRLP54845 237 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 KCNMA1Q12791 1236 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 RAPGEF1Q13905 1077 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 GAS6Q14393 721 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 WBP2Q969T9 261 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 TRIM62Q9BVG3 475 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 PLCB1Q9NQ66 1216 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 RPL34P49207 117 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 GAB4Q2WGN9 574 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 ANO4Q32M45 955 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 PLD4Q96BZ4 506 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 NOX5Q96PH1 765 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 PNKPQ96T60 521 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 PHOX2BQ99453 314 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 ACP6Q9NPH0 428 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 PCDHGC3Q9UN70 934 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 CEP83Q9Y592 693 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 FHOD1Q9Y613 1164 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 FANCMQ8IYD8 2048 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 SLC12A8A0AV02 714 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 PIK3R2O00459 728 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 RNF40O75150 1001 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 LTFP02788 710 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 UCHL3P15374 230 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 MRE11P49959 708 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 SATB1Q01826 763 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 Q6ZNB5 142 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 FAM71AQ8IYT1 594 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 EDEM1Q92611 657 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 MIS12Q9H081 205 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 ZSCAN32Q9NX65 697 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 APODP05090 189 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 HMBSP08397 361 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 KRT9P35527 623 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 CHKAP35790 457 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 SNX16P57768 344 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 NUDT18Q6ZVK8 323 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 ACDQ96AP0 544 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 MARK1Q9P0L2 795 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 MYOFQ9NZM1 2061 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 SMTNL1A8MU46 457 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 GABBR2O75899 941 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 ZNF18P17022 549 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 PDCLQ13371 301 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 TSSK4Q6SA08 328 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 TMEM25Q86YD3 366 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 NELL1Q92832 810 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 BBS2Q9BXC9 721 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 STK33Q9BYT3 514 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 LHX5Q9H2C1 402 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 ARHGEF4Q9NR80 690 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 R4GN57 208 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 LGALS16A8MUM7 142 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 CLCN1P35523 988 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 NCAPHQ15003 741 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 TMEM110Q86TL2 294 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX1-206ENST00000507253 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms