RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.02□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.02□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.02□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 CCL26Q9Y258 94 aa14.02□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SOBPA7XYQ1 873 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 HSF2BPO75031 334 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 CALB1P05937 261 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 PFKLP17858 780 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 MMP8P22894 467 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 CDC25BP30305 580 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC6A3Q01959 620 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 CENPCQ03188 943 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 E2F7Q96AV8 911 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC42Q96M95 316 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF38Q9H0F5 515 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 COX16Q9P0S2 106 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC12A8A0AV02 714 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD62A6NC57 917 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ECI2O75521 394 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 FCARP24071 287 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 TDGQ13569 410 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 TAF5Q15542 800 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 DCAF6Q58WW2 860 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 HGSNATQ68CP4 663 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 OLFML1Q6UWY5 402 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 XYLT1Q86Y38 959 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SCML4Q8N228 414 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAM32Q8TC27 787 aa14□□□□□ -0.17
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PGGT1B-204ENST00000503638 NXPE3Q969Y0 559 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
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PGGT1B-204ENST00000503638 SELENOOQ9BVL4 669 aa14□□□□□ -0.17
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PGGT1B-204ENST00000503638 KCNH6Q9H252 994 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 BRD9Q9H8M2 597 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 POPDC2Q9HBU9 364 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 GKN1Q9NS71 199 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 OBSL1O75147 1896 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ANHXE9PGG2 379 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 LEFTY2O00292 366 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF263O14978 683 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 MSI1O43347 362 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 FTLP02792 175 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 PSMC3P17980 439 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCB4P21439 1286 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 GDI1P31150 447 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 IFNAR2P48551 515 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC7A9P82251 487 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 CDK17Q00537 523 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 MTF1Q14872 753 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC122Q5T0U0 273 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 VITQ6UXI7 678 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB106AQ8N104 65 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC44A3Q8N4M1 653 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 TC2NQ8N9U0 490 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 PRSS33Q8NF86 280 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 EDAQ92838 391 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF34Q969K3 372 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF653Q96CK0 615 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 RSPRY1Q96DX4 576 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 TRIM11Q96F44 468 aa13.99□□□□□ -0.17
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