RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486448.1

AGR3-204, Transcript of anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member, human

TSL 3

Gene AGR3, Length 594 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AGR3-204	ENST00000486448	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		5	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	HOOK2	Q96ED9	719 aa		5	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	SUCLG2	Q96I99	432 aa		5	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	VPS50	Q96JG6	964 aa		5	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	FCRL5	Q96RD9	977 aa		5	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		5	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		5	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	DECR2	Q9NUI1	292 aa		5	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	TBX3	O15119	743 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	USP12	O75317	370 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	KLRC1	P26715	233 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	JAK3	P52333	1124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	PGGT1B	P53609	377 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	MEIS3	Q99687	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	COG5	Q9UP83	839 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	AKAP10	O43572	662 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	MARCH6	O60337	910 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	HSPA6	P17066	643 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	STK3	Q13188	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	PIGK	Q92643	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448		F8W810	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	CA12	O43570	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	GALNS	P34059	522 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	USP19	O94966	1318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AGR3-204	ENST00000486448	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	HOXB2	P14652	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	NTSR1	P30989	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	PPAT	Q06203	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	RAB27B	O00194	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	SPTLC2	O15270	562 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	SNX2	O60749	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	ARRB2	P32121	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	POLD2	P49005	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	CPT1A	P50416	773 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AGR3-204	ENST00000486448	P2RX3	P56373	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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