RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486139.1

AP001025.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP001025.1, Length 332 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP001025.1-201ENST00000486139 COL4A3Q01955 1670 aa3.01□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 MPPED1O15442 326 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PPP6R2O75170 966 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 KRT38O76015 456 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 WDR47O94967 919 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ONECUT2O95948 504 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PRKCBP05771 671 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ANXA6P08133 673 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 CDK4P11802 303 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PAX3P23760 479 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 SLC5A2P31639 672 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 CYP2C18P33260 490 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 BLOC1S1P78537 153 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 SCAPQ12770 1279 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PPFIA1Q13136 1202 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 SEMA3BQ13214 749 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 MPP3Q13368 585 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 GRM4Q14833 912 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PTPRRQ15256 657 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 BTBD16Q32M84 506 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 TBC1D25Q3MII6 688 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 FAM153CQ494X1 144 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 TMEM196Q5HYL7 178 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 DENND2CQ68D51 928 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ANKRD40Q6AI12 368 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 OLFML1Q6UWY5 402 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ZNF384Q8TF68 577 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 HMGB4Q8WW32 186 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 MLXIPQ9HAP2 919 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 USP29Q9HBJ7 922 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 FBXO28Q9NVF7 368 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 RRN3Q9NYV6 651 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 KIF17Q9P2E2 1029 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 LPAR3Q9UBY5 353 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 VPS4AQ9UN37 437 aa3□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 VWC2LB2RUY7 222 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 KIF28PB7ZC32 967 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PCDH17O14917 1159 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 KIAA0355O15063 1070 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PMPCBO75439 489 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 URI1O94763 535 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 NTSR2O95665 410 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 CER1O95813 267 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ITGA5P08648 1049 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 NPSP0C0P6 89 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 FAM163BP0C2L3 166 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 HSD3B1P14060 373 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 RXRAP19793 462 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 GKP32189 559 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PLA2G5P39877 138 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PBX1P40424 430 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 KRTAP10-11P60412 298 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 E2F1Q01094 437 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ST3GAL2Q16842 350 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 TXNRD1Q16881 649 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 NBPF8Q3BBV2 869 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 TMEM95Q3KNT9 176 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PCID2Q5JVF3 399 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 COLEC12Q5KU26 742 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 RAB11FIP2Q7L804 512 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 C2CD5Q86YS7 1000 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 METTL25Q8N6Q8 603 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 FAM71DQ8N9W8 422 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ABHD11Q8NFV4 315 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 SCAMP5Q8TAC9 235 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 SUN3Q8TAQ9 357 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 SOCS4Q8WXH5 440 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 GCC1Q96CN9 775 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ZDHHC12Q96GR4 267 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PBKQ96KB5 322 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 PRR25Q96S07 402 aa2.99□□□□□ -1.93
AP001025.1-201ENST00000486139 ISCA1Q9BUE6 129 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms