RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471572.6

NF1-208, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 2

Gene NF1, Length 2,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-208ENST00000471572 NKX3-2P78367 333 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CHRNEQ04844 493 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TCF15Q12870 199 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 PTPN14Q15678 1187 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 RAPH1Q70E73 1250 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 GLRX5Q86SX6 157 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 GDAP1Q8TB36 358 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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NF1-208ENST00000471572 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 MRI1Q9BV20 369 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 STOML1Q9UBI4 398 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 HESX1Q9UBX0 185 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 MAFFQ9ULX9 164 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.6□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 C2orf78A6NCI8 922 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TSPAN4O14817 238 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CCNDBP1O95273 360 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 METTL18O95568 372 aa6.59□□□□□ -1.35
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NF1-208ENST00000471572 PBX3P40426 434 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 DUSP2Q05923 314 aa6.59□□□□□ -1.35
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NF1-208ENST00000471572 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ZNF529Q6P280 563 aa6.59□□□□□ -1.35
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NF1-208ENST00000471572 GALNT7Q86SF2 657 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 NBPF11Q86T75 865 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TRABD2AQ86V40 505 aa6.59□□□□□ -1.35
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NF1-208ENST00000471572 SCAMP4Q969E2 229 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 WDR24Q96S15 920 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.59□□□□□ -1.35
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NF1-208ENST00000471572 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.59□□□□□ -1.35
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NF1-208ENST00000471572 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-208ENST00000471572 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-208ENST00000471572 SHROOM2Q13796 1616 aa6.58□□□□□ -1.36
NF1-208ENST00000471572 ARAP1Q96P48 1450 aa6.58□□□□□ -1.36
NF1-208ENST00000471572 PRXQ9BXM0 1461 aa6.58□□□□□ -1.36
NF1-208ENST00000471572 URADA6NGE7 173 aa6.58□□□□□ -1.36
NF1-208ENST00000471572 BTBD11A6QL63 1104 aa6.58□□□□□ -1.36
NF1-208ENST00000471572 NUDT19A8MXV4 375 aa6.58□□□□□ -1.36
NF1-208ENST00000471572 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NF1-208ENST00000471572 M0QYT0 321 aa6.58□□□□□ -1.36
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