RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465627.5

UBA3-208, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 3, human

TSL 2

Gene UBA3, Length 1,388 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBA3-208	ENST00000465627	LRCH4	O75427	683 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	TADA3	O75528	432 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CA3	P07451	260 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CXCR5	P32302	372 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	NDUFV1	P49821	464 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	MAP3K7CL	P57077	242 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	DAOA	P59103	153 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ITIH3	Q06033	890 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ADIG	Q0VDE8	80 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	TAZ	Q16635	292 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	PTPRO	Q16827	1216 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	USP41	Q3LFD5	358 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	LRRC38	Q5VT99	294 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF280D	Q6N043	979 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	VSTM1	Q6UX27	236 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	EMC1	Q8N766	993 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	PBK	Q96KB5	322 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	C8orf48	Q96LL4	319 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	SLC9A7	Q96T83	725 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	RAD9A	Q99638	391 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ST7	Q9NRC1	585 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	SPG21	Q9NZD8	308 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	INSL6	Q9Y581	213 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	WDR27	A2RRH5	827 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CCDC66	A2RUB6	948 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	LCHN	A4D1U4	455 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	MTMR11	A4FU01	709 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627		H7C4K7	107 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	PSTPIP1	O43586	416 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ENDOD1	O94919	500 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ABLIM3	O94929	683 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	GLI1	P08151	1106 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CYP2F1	P24903	491 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	IL1R2	P27930	398 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	AVPR2	P30518	371 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	PTPN9	P43378	593 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	TKTL1	P51854	596 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CDR1	P51861	262 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	SNX16	P57768	344 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	SMARCB1	Q12824	385 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CCDC14	Q49A88	953 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	RAB6C	Q53S08	254 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	BEND5	Q7L4P6	421 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	MS4A14	Q96JA4	679 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	YME1L1	Q96TA2	773 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	PSMB7	Q99436	277 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CNPY3	Q9BT09	278 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	MED10	Q9BTT4	135 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CARD6	Q9BX69	1037 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ZBP1	Q9H171	429 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	EHD2	Q9NZN4	543 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	RNF14	Q9UBS8	474 aa		9.23	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627		E7ENQ6	273 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UBA3-208	ENST00000465627	KCNK3	O14649	394 aa		9.22	□□□□□ -0.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms