RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 K7ESF4 209 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 MED7O43513 233 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 HMBSP08397 361 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 GNA15P30679 374 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 DAOAP59103 153 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 BSPRYQ5W0U4 402 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 C12orf40Q86WS4 652 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 SCML4Q8N228 414 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 RNF139Q8WU17 664 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 HSFY1Q96LI6 401 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 SIX2Q9NPC8 291 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 ANO10Q9NW15 660 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 SLC8A2Q9UPR5 921 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 FAM186AA6NE01 2351 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 SLC12A8A0AV02 714 aa25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 THAP12O43422 761 aa25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 GABBR2O75899 941 aa25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 DENND1BQ6P3S1 775 aa25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 NAT16Q8N8M0 369 aa25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF606Q8WXB4 792 aa25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 SHC3Q92529 594 aa25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 EDEM1Q92611 657 aa25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 ACP6Q9NPH0 428 aa25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF4Q9NR80 690 aa25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC12Q9UKB3 198 aa25.11■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 DMDP11532 3685 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 BECN2A8MW95 431 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 K7EQS6 105 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 LILRB5O75023 590 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 KAT7O95251 611 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 APODP05090 189 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 GPD2P43304 727 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 FNTBP49356 437 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 SEC13P55735 322 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 KDSRQ06136 332 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 STX1AQ16623 288 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 Q6ZNB5 142 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 TPGS1Q6ZTW0 290 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 IRGQQ8WZA9 623 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 DCLK3Q9C098 648 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 ST7Q9NRC1 585 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 ABCC13Q9NSE7 274 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF510Q9Y2H8 683 aa25.1■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO21O94952 628 aa25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 KLKB1P03952 638 aa25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 DMWDQ09019 674 aa25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 MESP2Q0VG99 397 aa25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 MEA1Q16626 185 aa25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 ACDQ96AP0 544 aa25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 BBS2Q9BXC9 721 aa25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 MIS12Q9H081 205 aa25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 WDR35Q9P2L0 1181 aa25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 TULP3O75386 442 aa25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 HOXC13P31276 330 aa25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 GRIA2P42262 883 aa25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 C2orf27AQ580R0 203 aa25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 FMNL3Q8IVF7 1028 aa25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 USP33Q8TEY7 942 aa25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 CLEC4CQ8WTT0 213 aa25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA1Q92805 767 aa25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 DEC1Q9P2X7 70 aa25.08■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 TYRP14679 529 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 HOXA6P31267 233 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 ACADSBP45954 432 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 SYT13Q7L8C5 426 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 LONP2Q86WA8 852 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 SFTPA1Q8IWL2 248 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 SUMF1Q8NBK3 374 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 PLD4Q96BZ4 506 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 FANCLQ9NW38 375 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 MARK1Q9P0L2 795 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 GPR179Q6PRD1 2367 aa25.07■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 LTFP02788 710 aa25.06■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 TPM2P07951 284 aa25.06■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 CHKAP35790 457 aa25.06■■□□□ 1.6
SMKR1-201ENST00000462322 RPL34P49207 117 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms