RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-208	ENST00000452550	LACTBL1	A8MY62	500 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	TGM5	O43548	720 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	EXTL3	O43909	919 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	HUS1	O60921	280 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	GLP2R	O95838	553 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	TNNC2	P02585	160 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	GSN	P06396	782 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	C8A	P07357	584 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SYP	P08247	313 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	NAT2	P11245	290 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	AFM	P43652	599 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	ACOT2	P49753	483 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	ARPP19	P56211	112 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	RAB33A	Q14088	237 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SV2C	Q496J9	727 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	RTP2	Q5QGT7	225 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	TPGS2	Q68CL5	300 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SHC4	Q6S5L8	630 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	GPD1L	Q8N335	351 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SUSD6	Q92537	303 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	RABGGTA	Q92696	567 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	CCDC120	Q96HB5	630 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	RMND1	Q9NWS8	449 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	MTRR	Q9UBK8	725 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1W2PQ27	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1W2PQ64	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1W2PQD8	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550		H0Y8X5	98 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF197	O14709	1029 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	B4GALT3	O60512	393 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	EXOC3	O60645	756 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF205	O95201	554 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SMC2	O95347	1197 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	EDN1	P05305	212 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	KRT19	P08727	400 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SPATA31D3	P0C874	917 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	TNNI1	P19237	187 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	TYMP	P19971	482 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	LRPAP1	P30533	357 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	HOXA9	P31269	272 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	ALDH1A3	P47895	512 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	TAF6	P49848	677 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	AP3M2	P53677	418 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	RBP5	P82980	135 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	TSPY1	Q01534	308 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SMARCB1	Q12824	385 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRPC3	Q13507	836 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	STIM1	Q13586	685 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	KCNC3	Q14003	757 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	VEPH1	Q14D04	833 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	DDR2	Q16832	855 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SPATA1	Q5VX52	437 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	JADE1	Q6IE81	842 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	FSIP1	Q8NA03	581 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	LEMD2	Q8NC56	503 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SH3BGR-208	ENST00000452550	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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