RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SERPINE1P05121 402 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 YES1P07947 543 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PRKACAP17612 351 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SLC26A3P40879 764 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PRKAA2P54646 552 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ACTR3P61158 418 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 USP49Q70CQ1 688 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 THAP2Q9H0W7 228 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DDIASQ8IXT1 998 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SCFD2Q8WU76 684 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM162AQ96A26 154 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ANO3Q9BYT9 981 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 EHD3Q9NZN3 535 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1B0GVG6 124 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KCNN4O15554 427 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 APOL3O95236 402 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RALBP11234 206 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GZMAP12544 262 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NPR3P17342 541 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PIK3R1P27986 724 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ADORA1P30542 326 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TALDO1P37837 337 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 EID3Q8N140 333 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 WDR41Q9HAD4 459 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GUCY1A2P33402 732 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 THOP1P52888 689 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TTC23LQ6PF05 361 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RNF34Q969K3 372 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TMCO6Q96DC7 493 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM89AQ96GI7 184 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LDLRP01130 860 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 IP6K1Q92551 441 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MED30Q96HR3 178 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.65□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 C6orf229H3BNL8 230 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DCXO43602 365 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ST3GAL1Q11201 340 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 UGP2Q16851 508 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GALNTL6Q49A17 601 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MROH9Q5TGP6 573 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CENPPQ6IPU0 288 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.64□□□□□ -1.35
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SBNO1-202ENST00000420886 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.64□□□□□ -1.35
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SBNO1-202ENST00000420886 POLBP06746 335 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ATF6P18850 670 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GTF2H1P32780 548 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GJA9P57773 515 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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SBNO1-202ENST00000420886 FAM47BQ8NA70 645 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 IL17REQ8NFR9 667 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 EXD1Q8NHP7 514 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RMDN3Q96TC7 470 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SNAP23O00161 211 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CHKAP35790 457 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PHKA2P46019 1235 aa6.64□□□□□ -1.35
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