RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PATJQ8NI35 1801 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 NARSO43776 548 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ORC4O43929 436 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 OFD1O75665 1012 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 CXCL14O95715 111 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 AMY2AP04746 511 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 GLI4P10075 376 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 INSRRP14616 1297 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 LAG3P18627 525 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 AMY2BP19961 511 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MC3RP41968 323 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 KIF11P52732 1056 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 EPHA5P54756 1037 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SCAND1P57086 179 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 KCNC3Q14003 757 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 NEDD9Q14511 834 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 EMC4Q5J8M3 183 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 KIAA1841Q6NSI8 718 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 METTL7BQ6UX53 244 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 CABP7Q86V35 215 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 NOSTRINQ8IVI9 506 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 CARFQ8N187 725 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 RNF169Q8NCN4 708 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ATRIPQ8WXE1 791 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 RSAD2Q8WXG1 361 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 GLG1Q92896 1179 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 E2F7Q96AV8 911 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 RAX2Q96IS3 184 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF558Q96NG5 402 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 GPR20Q99678 358 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ADAM2Q99965 735 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 RTKNQ9BST9 563 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 LRRCC1Q9C099 1032 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ECHDC1Q9NTX5 307 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 DSEQ9UL01 958 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 LZTS1Q9Y250 596 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MYRFQ9Y2G1 1151 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 TRPV2Q9Y5S1 764 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ASXL3Q9C0F0 2248 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MAST4O15021 2626 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MAN2B1O00754 1011 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 LAMTOR5O43504 91 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHGA12O60330 932 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 KDM1AO60341 852 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 EPCAMP16422 314 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SLC9A1P19634 815 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ENPP1P22413 925 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PPM1AP35813 382 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SLC6A11P48066 632 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SLC5A3P53794 718 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 HAND2P61296 217 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ADAM17P78536 824 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 LPAL2Q16609 132 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MIER2Q8N344 545 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SUMF1Q8NBK3 374 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 TSPAN17Q96FV3 270 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 AMNQ9BXJ7 453 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MAF1Q9H063 256 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ZMAT4Q9H898 229 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 KAT14Q9H8E8 782 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SPG21Q9NZD8 308 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 GMEB2Q9UKD1 530 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 RAB23Q9ULC3 237 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 TELO2Q9Y4R8 837 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms