RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 RNF139Q8WU17 664 aa21.36■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 YIPF1Q9Y548 306 aa21.36■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.35■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.35■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 KRT10P13645 584 aa21.34■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 TAC4Q86UU9 113 aa21.34■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.34■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 TLR9Q9NR96 1032 aa21.34■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 FAM92AA1XBS5 289 aa21.33■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 MDM4O15151 490 aa21.33■■□□□ 1
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ATG4B-204ENST00000402096 CDKN2BP42772 138 aa21.33■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 UBE3AQ05086 875 aa21.33■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 TWF1Q12792 350 aa21.33■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.33■■□□□ 1
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ATG4B-204ENST00000402096 OSER1Q9NX31 292 aa21.33■■□□□ 1
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ATG4B-204ENST00000402096 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 TGM5O43548 720 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 TJP3O95049 919 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 RB1P06400 928 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 CSH1P0DML2 217 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 CSH2P0DML3 217 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 PSEN1P49768 467 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 PDK2Q15119 407 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 PPP2R5EQ16537 467 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 CA9Q16790 459 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 RFX6Q8HWS3 928 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 MAFFQ9ULX9 164 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 CEP290O15078 2479 aa21.32■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.31■■□□□ 1
ATG4B-204ENST00000402096 HIDE1A8MVS5 230 aa21.31■■□□□ 1
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