RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 HMBSP08397 361 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 MFAP3P55082 362 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 COG7P83436 770 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 APBA1Q02410 837 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 MAN2A1Q16706 1144 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 Q6ZNB5 142 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 SYT13Q7L8C5 426 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 USP33Q8TEY7 942 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 RUBCNQ92622 972 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 HHIPQ96QV1 700 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC12A8A0AV02 714 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 E7ENQ6 273 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 HRO43593 1189 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 TULP3O75386 442 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 GABBR2O75899 941 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 KLKB1P03952 638 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 GRIA2P42262 883 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 DAOAP59103 153 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 DMC1Q14565 340 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 LPAL2Q16609 132 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 PHTF2Q8N3S3 785 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 DCLK2Q8N568 766 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 EDEM1Q92611 657 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM81BQ96LP2 452 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 BBS2Q9BXC9 721 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 DEC1Q9P2X7 70 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 NCDNQ9UBB6 729 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.2■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 PON1P27169 355 aa21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 CNR2P34972 360 aa21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 USP8P40818 1118 aa21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 SCML4Q8N228 414 aa21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF139Q8WU17 664 aa21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB23Q9ULC3 237 aa21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 USP34Q70CQ2 3546 aa21.19■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 EML5Q05BV3 1969 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0A0MRY4 1105 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 TYRP14679 529 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 VWA3BQ502W6 1294 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 HSFY1Q96LI6 401 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 DCLK3Q9C098 648 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 NDST4Q9H3R1 872 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 ACP6Q9NPH0 428 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 MARK1Q9P0L2 795 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.18■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D3BA6NDS4 549 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 BECN2A8MW95 431 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNJ18B7U540 433 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM24O15164 1050 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 THAP12O43422 761 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 MED7O43513 233 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 TIE1P35590 1138 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 GPD2P43304 727 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 TNFRSF4P43489 277 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNJ12Q14500 433 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 MIIPQ5JXC2 388 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 EMC10Q5UCC4 262 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 GRAMD4Q6IC98 578 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 DENND1CQ8IV53 801 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 IRGQQ8WZA9 623 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 BHMTQ93088 406 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 PLD4Q96BZ4 506 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
ANKRD39-201ENST00000393537 SIX2Q9NPC8 291 aa21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms