RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 M0QYV0 167 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 KAT7O95251 611 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CALCAP01258 141 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT5P13647 590 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 MAN2A1Q16706 1144 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ANO4Q32M45 955 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 PMF1Q6P1K2 205 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 PHTF2Q8N3S3 785 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 USP33Q8TEY7 942 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ACDQ96AP0 544 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 HSFY1Q96LI6 401 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 MARK1Q9P0L2 795 aa21.58■■□□□ 1.05
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UBE2E3-201ENST00000392415 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 HRO43593 1189 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 GABBR2O75899 941 aa21.57■■□□□ 1.04
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UBE2E3-201ENST00000392415 PON1P27169 355 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 GRIA2P42262 883 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 MFAP3P55082 362 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 DAOAP59103 153 aa21.57■■□□□ 1.04
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UBE2E3-201ENST00000392415 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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UBE2E3-201ENST00000392415 NAT16Q8N8M0 369 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 ANTXRLA6NF34 631 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 E7ENQ6 273 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 TULP3O75386 442 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 LCP1P13796 627 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 RGS7P49802 495 aa21.56■■□□□ 1.04
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UBE2E3-201ENST00000392415 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 C2orf27AQ580R0 203 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 SFTPA1Q8IWL2 248 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 DCLK3Q9C098 648 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 DEC1Q9P2X7 70 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 GPD2P43304 727 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 TNFRSF4P43489 277 aa21.55■■□□□ 1.04
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UBE2E3-201ENST00000392415 VWA3BQ502W6 1294 aa21.55■■□□□ 1.04
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UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 IRGQQ8WZA9 623 aa21.55■■□□□ 1.04
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UBE2E3-201ENST00000392415 NDST4Q9H3R1 872 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 EML5Q05BV3 1969 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC12A8A0AV02 714 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 BECN2A8MW95 431 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 CACNG3O60359 315 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 HMBSP08397 361 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 TYRP14679 529 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 KDSRQ06136 332 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 MIIPQ5JXC2 388 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 DCLK2Q8N568 766 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF139Q8WU17 664 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 SHC3Q92529 594 aa21.55■■□□□ 1.04
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UBE2E3-201ENST00000392415 HHIPQ96QV1 700 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 HINFPQ9BQA5 517 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 SIX2Q9NPC8 291 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
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UBE2E3-201ENST00000392415 SPAG17Q6Q759 2223 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D3BA6NDS4 549 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 PIK3R2O00459 728 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 MED7O43513 233 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 GNA15P30679 374 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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UBE2E3-201ENST00000392415 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3-201ENST00000392415 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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