RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383868.1

RNU6-877P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 877, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-877P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-877P-201ENST00000383868 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-877P-201ENST00000383868 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-877P-201ENST00000383868 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-877P-201ENST00000383868 FYB1O15117 783 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 MT-ND5P03915 603 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 FGF2P09038 288 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 SNHG28P0DPA3 235 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 RPL17P18621 184 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 FAM193AP78312 1265 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 DNASE1L3Q13609 305 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 GALEQ14376 348 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 KCNAB1Q14722 419 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 KLHL22Q53GT1 634 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 FAM227BQ96M60 508 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 MLXIPLQ9NP71 852 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 VPS45Q9NRW7 570 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ZNF580Q9UK33 172 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 RRHO14718 337 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 TSPAN6O43657 245 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 CBFA2T3O75081 653 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 TNFRSF1BP20333 461 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 PEX2P28328 305 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 TACR3P29371 465 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 CCKARP32238 428 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 MTX1Q13505 466 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 SEMA5AQ13591 1074 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 GRM3Q14832 879 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ACOX1Q15067 660 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 VPS50Q96JG6 964 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 MARK4Q96L34 752 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 SNX22Q96L94 193 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 TRMOQ9BU70 441 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 TM2D2Q9BX73 214 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 BTBD1Q9H0C5 482 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 HPSEQ9Y251 543 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 A0A087WZ62 844 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 CD8B2A6NJW9 211 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 F8W8V4 182 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 CA12O43570 354 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 MGEA5O60502 916 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 SNX2O60749 519 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 TMEM225BP0DP42 221 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 RHCEP18577 417 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 GALNSP34059 522 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ME1P48163 572 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 THBS3P49746 956 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 RHDQ02161 417 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 KIAA0753Q2KHM9 967 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 KRT28Q7Z3Y7 464 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 BCAS4Q8TDM0 211 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 WDR24Q96S15 920 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 USP29Q9HBJ7 922 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 POT1Q9NUX5 634 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 LRP12Q9Y561 859 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 INPPL1O15357 1258 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 WDR47O94967 919 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-877P-201ENST00000383868 PLAUP00749 431 aa3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms