RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF2A2P52657 109 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM182AQ5T1J6 154 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ZFATQ9P243 1243 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 GJD2Q9UKL4 321 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 H0Y3Z8 333 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 GABBR2O75899 941 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ARFIP2P53365 341 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 NOMO1Q15155 1222 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 LMNTD2Q8IXW0 634 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 APOPT1Q96IL0 206 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.81■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ACADSP16219 412 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ETV4P43268 484 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 NEK3P51956 506 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB6Q15916 424 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC6Q86X45 466 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SKA1Q96BD8 255 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 CFAP69A5D8W1 941 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 PRPSAP2O60256 369 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 IL4RP24394 825 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 PTK7Q13308 1070 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 STILQ15468 1287 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SCUBE3Q8IX30 993 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 NSL1Q96IY1 281 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 MIS12Q9H081 205 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNK13Q9HB14 408 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ARL8BQ9NVJ2 186 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 CHMP2BQ9UQN3 213 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 DERAQ9Y315 318 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 IKBKGQ9Y6K9 419 aa24.8■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC189A1A4V9 331 aa24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 HCRTO43612 131 aa24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 IL1BP01584 269 aa24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 BASP1P80723 227 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 CDK16Q00536 496 aa24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC18A2Q05940 514 aa24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ANO7Q6IWH7 933 aa24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC35F5Q8WV83 523 aa24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 OSMRQ99650 979 aa24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 STOML1Q9UBI4 398 aa24.79■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 GLTPD2A6NH11 291 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 GCKP35557 465 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ROR1Q01973 937 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 RFWD3Q6PCD5 774 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC44A1Q8WWI5 657 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJC9Q8WXX5 260 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF157Q96PX1 679 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 B3GNT5Q9BYG0 378 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 DPYSL4O14531 572 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 GSC2O15499 205 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT72Q14CN4 511 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM110Q86TL2 294 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SERAC1Q96JX3 654 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SCN4AP35499 1836 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SPAG6O75602 509 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 DLDP09622 509 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SERPINB3P29508 390 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ELK3P41970 407 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC6A3Q01959 620 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIK3Q13003 919 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SCYL2Q6P3W7 929 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 C1orf228Q6PIY5 440 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SH2D5Q6ZV89 423 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 GYG2O15488 501 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 INHBAP08476 426 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB16Q05516 673 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms