RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 MANEAQ5SRI9 462 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 TM2D2Q9BX73 214 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 NUAK2Q9H093 628 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 STEAP1Q9UHE8 339 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 KIF21BO75037 1637 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 AKAP10O43572 662 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 MARCH6O60337 910 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 USP12O75317 370 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 PIAS2O75928 621 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 TGFB3P10600 412 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 SLC7A1P30825 629 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 ZXDBP98169 803 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 RHDQ02161 417 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 HYAL1Q12794 435 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 USP49Q70CQ1 688 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 FAM57BQ71RH2 274 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 MAEAQ7L5Y9 396 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 SLC25A28Q96A46 364 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 P2RY11Q96G91 374 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 VPS50Q96JG6 964 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 TAAR9Q96RI9 348 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 ZPBPQ9BS86 351 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 PEG3Q9GZU2 1588 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 DOCK7Q96N67 2140 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 RRHO14718 337 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 SLC28A2O43868 658 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 TUSC2O75896 110 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 EPN2O95208 641 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 CLCA4Q14CN2 919 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 NPNTQ6UXI9 565 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 FCRL5Q96RD9 977 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 USP29Q9HBJ7 922 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 STK32BQ9NY57 414 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 SELENONQ9NZV5 590 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 CEP164Q9UPV0 1460 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 SYNJ1O43426 1573 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 CLIP1P30622 1438 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRK-202ENST00000368205 E2F8A0AVK6 867 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 AQP7P3A6NL99 342 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 CTIFO43310 598 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 PRAMEF2O60811 474 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 RASSF9O75901 435 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 JAK3P52333 1124 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 PGGT1BP53609 377 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 SLC12A2P55011 1212 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF585BQ52M93 769 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 SCNM1Q9BWG6 230 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 VPS51Q9UID3 782 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ICKQ9UPZ9 632 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 BICRAQ9NZM4 1560 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 VPS8Q8N3P4 1428 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ISM1B1AKI9 464 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 F8W810 466 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 SPTLC2O15270 562 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 FRS3O43559 492 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 RPS6KB1P23443 525 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ACVR2AP27037 513 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 CPT1AP50416 773 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 SLC29A2Q14542 456 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 RFX8Q6ZV50 586 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms