RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP-0.71□□□□□ -2.52
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM88BA6NKF7 163 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2CD4BA6NLJ0 364 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLGNO14967 610 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LDHBP07195 334 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IL2RBP14784 551 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP6V1B1P15313 513 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHKG2P15735 406 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLCN2P51788 898 aa-0.72□□□□□ -2.52
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FLIIQ13045 1269 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2orf83Q53S99 150 aa-0.72□□□□□ -2.52
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM47CQ5HY64 1035 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TREML2Q5T2D2 321 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIAA1841Q6NSI8 718 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RANBP10Q6VN20 620 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNMB4Q86W47 210 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NME9Q86XW9 330 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKRD44Q8N8A2 993 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF480Q8WV37 535 aa-0.72□□□□□ -2.52
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM136AQ96C01 138 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 WNT8AQ9H1J5 351 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CYTL1Q9NRR1 136 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BRWD1Q9NSI6 2320 aa-0.72□□□□□ -2.53
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 MT-CO3P00414 261 aa-0.73□□□□□ -2.53
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 INPP5DQ92835 1189 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TLR10Q9BXR5 811 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NTN4Q9HB63 628 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC66A2RUB6 948 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UNCXA6NJT0 531 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHOX2AO14813 284 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 INPPL1O15357 1258 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADCY6O43306 1168 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRP3O75074 770 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IFNA2P01563 188 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNA5P22460 613 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAPK1P28482 360 aa-0.74□□□□□ -2.53
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